Brak prawa do odliczenia podatku naliczonego w związku z realizacją projektu.
Samodzielny Szpital, będący publicznym zakładem opieki zdrowotnej i czynnym podatnikiem VAT, planuje zakup sprzętu medycznego w ramach projektu dofinansowanego z funduszy unijnych. Szpital świadczy zarówno usługi medyczne zwolnione z VAT (np. w ramach kontraktu z NFZ), jak i niektóre usługi opodatkowane (np. podnajem pomieszczeń). Projekt zakłada, że zakupiony sprzęt będzie wykorzystywany…
Interpretacja indywidualna – stanowisko prawidłowe
Szanowni Państwo,
stwierdzam, że Państwa stanowisko w sprawie oceny skutków podatkowych opisanego zdarzenia przyszłego w podatku od towarów i usług jest prawidłowe.
Zakres wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej
16 stycznia 2026 r. wpłynął Państwa wniosek z 12 stycznia 2026 r. o wydanie interpretacji indywidualnej, który dotyczy braku prawa do odliczenia podatku naliczonego w związku z realizacją projektu pt. „...”. Uzupełnili go Państwo pismem z 16 lutego 2026 r. – w odpowiedzi na wezwanie.
Treść wniosku jest następująca:
Opis zdarzenia przyszłego
Samodzielny Szpital ... w ... (Zakład) będąc podmiotem leczniczym wpisanym do rejestru podmiotów wykonujących działalność leczniczą funkcjonuje w oparciu o ustawę z dnia 15.04.2011 r. o działalności leczniczej, pozostaje czynnym podatnikiem podatku od towarów i usług.
Podatnik podjął decyzję o przeprowadzeniu inwestycji polegającej na zakupie:
- wieży endoskopowej,
- gastroskopu,
- kolonoskopu,
- myjki z wyposażeniem,
- aparatu do znieczulania,
- autoklawu,
- myjki ultradźwiękowej,
- systemu hydrochirurgicznego,
- lampy wirusobójczej i bakteriobójczej,
- skanera naczyń krwionośnego z wyświetlaczem,
- aparatu ABI,
- stacjonarnego zestawu rektoskopowego,
- aparatu do diatermii,
- staloku - wózek pod aparaturę,
- ligatoru hemoroidalnego,
- aparatu do kriochirurgii,
- komputera z monitorem,
- urządzenia wielofunkcyjnego,
- ultrasonografu serca,
- zestawu holterowskiego z wyposażeniem,
- rejestratora ciśnienia tętniczego krwi holter RR z osprzętem.
Samodzielny Szpital ... w ... jest publicznym zakładem opieki zdrowotnej prowadzonym w formie samodzielnego zakładu. Podstawową działalnością Zakładu jest działalność medyczna realizowana w ramach kontraktu z NFZ. Zakład świadczy usługi medyczne dla osób znajdujących się w stanie zagrożenia zdrowia i życia, za które wystawia faktury ze stawką zw zgodnie z art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy o podatku od towarów i usług.
Jednocześnie Zakład świadczy usługi komercyjne sprzedaż usług laboratoryjnych, RTG, USG, w ramach podpisanych umów (sprzedaż zw). Zakład prowadzi również poradnię medycyny pracy, w ramach której sprzedaje usługi zw jak i opodatkowane. Zakład świadczy usługi opodatkowane polegające na podnajmie wynajmowanych przez siebie pomieszczeń (sprzedaż opodatkowana ujmowana jest w rejestrze VAT z odpowiednią stawką).
Ponadto Wnioskodawca wskazał, że:
1) Projekt dofinansowania dotyczy ogłoszonego konkursu przez Zarząd Województwa ... jako ... dla ... na lata 2021-2027 w ramach Priorytetu IV. ... pt. „...”. Szpital umowę na dofinansowanie podpisał w dniu 13.01.2026 r.
2) W ramach realizowanego projektu Szpital będzie świadczył usługi medyczne, służące profilaktyce, zachowaniu, ratowaniu, przywracaniu i poprawie zdrowia, w ramach działalności leczniczej przez Szpital. Usługi te korzystają ze zwolnienia z art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy z dnia 11.03.2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. z 2025 poz. 775 ze zm.).
3) W związku z realizacją projektu efekty będą dotyczyć czynności zwolnionych od podatku VAT.
4) Faktury dokumentujące wydatki w związku z realizacją projektu będą wystawione na Samodzielny Szpital ... w ..., bo jest to podmiot, który te wydatki będzie ponosił.
Pytanie
Czy na gruncie stanu Wnioskodawcy będzie przysługiwało prawo do odliczenia podatku naliczonego od wydatków związanych z opisanym wcześniej projektem według proporcji, o której mowa w art. 90 ust. 1 i 2 ustawy?
Państwa stanowisko w sprawie
Zdaniem Wnioskodawcy, z uwagi na fakt, iż Wnioskodawca będzie miał możliwość bezpośredniego - obiektywnego i miarodajnego przypisania zakupu towarów i usług dotyczących opisanego projektu w całości do celów działalności zwolnionej nie będzie przysługiwało mu prawo do odliczenia podatku naliczonego od ww. wydatków według proporcji, o której mowa w art. 90 ust. 2 i 3 ustawy.
Art. 90 ustawy ma zastosowanie w sytuacji, gdy dokonanie bezpośredniej alokacji nie będzie możliwe. W przypadku gdy dokonane zakupy służyć będą obu rodzajom działalności, podatnik może odliczyć tę część podatku naliczonego, którą można proporcjonalnie przypisać czynnościom dającym prawo do odliczenia. Zatem, zasada proporcjonalnego odliczenia podatku ma zastosowanie do tej kategorii zakupów, których nie da się jednoznacznie przypisać do konkretnego rodzaju sprzedaży, czyli do zakupów związanych ze sprzedażą opodatkowaną i zwolnioną. Dofinansowana w ramach projektu infrastruktura wykorzystywana będzie wyłącznie na potrzeby udzielania świadczeń zdrowotnych finansowanych ze środków publicznych oraz celem nadrzędnym projektu jest wzrost bezpieczeństwa zdrowotnego pacjentów.
W związku z tym przedmiot wniosku będzie wykorzystywany do czynności wyłącznie zwolnionych z VAT.
Ponadto w uzupełnieniu wniosku Wnioskodawca wskazał, że w ramach zakupionego sprzętu medycznego z dofinansowania projektu nie będzie przysługiwało odliczenie podatku naliczonego, w związku z korzystaniem ze zwolnienia z art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy o podatku od towarów i usług.
Ocena stanowiska
Stanowisko, które przedstawili Państwo we wniosku jest prawidłowe.
Uzasadnienie interpretacji indywidualnej
Zgodnie z przepisem art. 86 ust. 1 ustawy z 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (t. j. Dz. U. z 2025 r. poz. 775 ze zm.), zwanej dalej ustawą:
W zakresie, w jakim towary i usługi są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych, podatnikowi, o którym mowa w art. 15, przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego, z zastrzeżeniem art. 114, art. 119 ust. 4, art. 120 ust. 17 i 19 oraz art. 124.
W myśl art. 86 ust. 2 pkt 1 lit. a) ustawy:
Kwotę podatku naliczonego stanowi suma kwot podatku wynikających z faktur otrzymanych przez podatnika z tytułu nabycia towarów i usług.
Z art. 87 ust. 1 ustawy wynika, że:
W przypadku, gdy kwota podatku naliczonego, o której mowa w art. 86 ust. 2, jest w okresie rozliczeniowym wyższa od kwoty podatku należnego, podatnik ma prawo do obniżenia o tę różnicę kwoty podatku należnego za następne okresy lub do zwrotu różnicy na rachunek bankowy.
Z powołanych przepisów wynika, że prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego przysługuje wówczas, gdy zostaną spełnione określone warunki, tzn. odliczenia tego dokonuje podatnik podatku od towarów i usług oraz gdy towary i usługi, z których nabyciem podatek został naliczony, są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych, tzn. takich, których następstwem jest określenie podatku należnego.
Odliczyć zatem można w całości podatek naliczony, który jest związany z transakcjami opodatkowanymi podatnika. Wskazana zasada wyłącza tym samym możliwość dokonywania odliczeń podatku naliczonego związanego z towarami i usługami, które nie są w ogóle wykorzystywane do czynności opodatkowanych, czyli w przypadku ich wykorzystywania do czynności zwolnionych od podatku lub niepodlegających opodatkowaniu. Jednocześnie z zasady tej wynika, że odliczenie podatku naliczonego może być częściowe, tzn. w tej części, w jakiej dane towary lub usługi, z którymi związany jest podatek naliczony są wykorzystywane do realizacji czynności opodatkowanych, z pominięciem tej części podatku od tych towarów i usług, w jakiej towary te (usługi) są wykorzystywane do wykonywania czynności nieopodatkowanych.
Wyrażoną w cytowanym powyżej art. 86 ust. 1 ustawy o VAT generalną zasadę uprawniającą do odliczenia podatku naliczonego uzupełniają regulacje zawarte w art. 90 ustawy.
Zgodnie z art. 90 ust. 1 ustawy:
W stosunku do towarów i usług, które są wykorzystywane przez podatnika do wykonywania czynności, w związku z którymi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, jak i czynności, w związku z którymi takie prawo nie przysługuje, podatnik jest obowiązany do odrębnego określenia kwot podatku naliczonego związanych z czynnościami, w stosunku do których podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego.
W myśl art. 90 ust. 2 ustawy:
Jeżeli nie jest możliwe wyodrębnienie całości lub części kwot, o których mowa w ust. 1, podatnik może pomniejszyć kwotę podatku należnego o taką część kwoty podatku naliczonego, którą można proporcjonalnie przypisać czynnościom, w stosunku do których podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, z zastrzeżeniem ust. 10.
Stosownie do art. 90 ust. 3 ustawy:
Proporcję, o której mowa w ust. 2, ustala się jako udział rocznego obrotu z tytułu czynności, w związku z którymi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, w całkowitym obrocie uzyskanym z tytułu czynności, w związku z którymi podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, oraz czynności, w związku z którymi podatnikowi nie przysługuje takie prawo.
Z uwagi na brzmienie cytowanych przepisów należy zauważyć, że obowiązkiem podatnika w pierwszej kolejności jest przypisanie konkretnych wydatków do określonego rodzaju sprzedaży, z którymi wydatki te są związane. Podatnik ma zatem obowiązek odrębnego określenia, z jakim rodzajem działalności będzie związany podatek wynikający z otrzymanych „faktur zakupu”, czyli dokonania tzw. bezpośredniej alokacji. Jeżeli takie wyodrębnienie jest możliwe, podatnikowi przysługuje pełne prawo do odliczenia podatku naliczonego przy nabyciu towarów i usług związanych ze sprzedażą opodatkowaną, brak jest natomiast takiego prawa w stosunku do towarów i usług wykorzystywanych do wykonywania czynności niepodlegających temu podatkowi oraz zwolnionych od podatku.
W sytuacji natomiast, gdy nie jest możliwe wyodrębnienie całości lub części kwot podatku związanego z czynnościami, w stosunku do których przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego oraz związanego z czynnościami, w związku z którymi takie prawo nie przysługuje, podatnik jest obowiązany do proporcjonalnego rozliczenia podatku naliczonego, zgodnie z art. 90 ust. 2 ustawy.
Ponadto podkreślić należy, że ustawodawca stworzył podatnikowi prawo do odliczenia podatku naliczonego w całości lub w części, pod warunkiem spełnienia przez niego zarówno przesłanek pozytywnych, wynikających z art. 86 ust. 1 ustawy oraz niezaistnienia przesłanek negatywnych, określonych w art. 88 ustawy. Ten ostatni przepis określa listę wyjątków, które pozbawiają podatnika prawa do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego.
Na zakres prawa do odliczeń w sposób bezpośredni wpływa również pojmowanie statusu danego podmiotu jako podatnika podatku od towarów i usług wykonującego czynności opodatkowane. Tylko podatnik w rozumieniu art. 15 ustawy, ma prawo do odliczenia podatku naliczonego. Co do zasady status podatnika związany jest z prowadzeniem przez dany podmiot działalności gospodarczej w rozumieniu ustawy.
Stosownie do art. 15 ust. 1 ustawy:
Podatnikami są osoby prawne, jednostki organizacyjne niemające osobowości prawnej oraz osoby fizyczne, wykonujące samodzielnie działalność gospodarczą, o której mowa w ust. 2, bez względu na cel lub rezultat takiej działalności.
Na podstawie art. 15 ust. 2 ustawy”
Działalność gospodarcza obejmuje wszelką działalność producentów, handlowców lub usługodawców, w tym podmiotów pozyskujących zasoby naturalne oraz rolników, a także działalność osób wykonujących wolne zawody. Działalność gospodarcza obejmuje w szczególności czynności polegające na wykorzystywaniu towarów lub wartości niematerialnych i prawnych w sposób ciągły dla celów zarobkowych.
Z przedstawionego opisu sprawy wynika, że są Państwo czynnym podatnikiem podatku od towarów i usług oraz podmiotem leczniczym wpisanym do rejestru podmiotów wykonujących działalność leczniczą. Są Państwo publicznym zakładem opieki zdrowotnej prowadzonym w formie samodzielnego zakładu. Podstawową działalnością Państwa jest działalność medyczna realizowana w ramach kontraktu z NFZ. Świadczą Państwo usługi medyczne dla osób znajdujących się w stanie zagrożenia zdrowia i życia, za które wystawiają Państwo faktury ze stawką zw zgodnie z art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy. Jednocześnie świadczą Państwo usługi komercyjne - sprzedaż usług laboratoryjnych, RTG, USG, w ramach podpisanych umów (sprzedaż zwolniona). Prowadzą Państwo również poradnię medycyny pracy, w ramach której sprzedają Państwo usługi zwolnione jak i opodatkowane. Świadczą Państwo usługi opodatkowane polegające na podnajmie wynajmowanych przez siebie pomieszczeń.
Podjęli Państwo decyzję o przeprowadzeniu inwestycji polegającej na zakupie wieży endoskopowej, gastroskopu, kolonoskopu, myjki z wyposażeniem, aparatu do znieczulania, autoklawu, myjki ultradźwiękowej, systemu hydrochirurgicznego, lampy wirusobójczej i bakteriobójczej, skanera naczyń krwionośnego z wyświetlaczem, aparatu ABI, stacjonarnego zestawu rektoskopowego, aparatu do diatermii, staloku - wózek pod aparaturę, ligatoru hemoroidalnego, aparatu do kriochirurgii, komputera z monitorem, urządzenia wielofunkcyjnego, ultrasonografu serca, zestawu holterowskiego z wyposażeniem, rejestratora ciśnienia tętniczego krwi holter RR z osprzętem.
Projekt dofinansowania dotyczy ogłoszonego konkursu przez Zarząd Województwa ... jako ... dla ... na lata 2021-2027 w ramach Priorytetu ... pt. „...”. Umowę na dofinansowanie podpisali Państwo 13.01.2026 r. W ramach realizowanego projektu będą Państwo świadczyć usługi medyczne, służące profilaktyce, zachowaniu, ratowaniu, przywracaniu i poprawie zdrowia, w ramach działalności leczniczej przez Szpital. Usługi te korzystają ze zwolnienia z art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy. W związku z realizacją projektu efekty będą dotyczyć czynności zwolnionych od podatku VAT. Faktury dokumentujące wydatki w związku z realizacją projektu będą wystawione na Państwa.
Wątpliwości Państwa dotyczą prawa do odliczenia podatku naliczonego od wydatków związanych z projektem, według proporcji, o której mowa w art. 90 ust. 1 i ust. 2 ustawy.
Jak wskazano na wstępie, rozliczenie podatku naliczonego na zasadach określonych w art. 86 ust. 1 ustawy uwarunkowane jest tym, aby nabywane towary i usługi były wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych podatkiem od towarów i usług. W omawianej sprawie warunek uprawniający do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego nie zostanie spełniony, ponieważ – jak Państwo wskazali – w ramach realizowanego projektu będą Państwo świadczyć usługi medyczne, służące profilaktyce, zachowaniu, ratowaniu, przywracaniu i poprawie zdrowia. Usługi te korzystają ze zwolnienia z art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy. Zatem efekty będą dotyczyć czynności zwolnionych od podatku VAT. W związku z powyższym, nie będą mieli Państwo prawa do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego w związku z wydatkami ponoszonymi z tytułu realizacji ww. projektu. Tym samym, z tego tytułu nie będzie Państwu przysługiwało prawo do zwrotu różnicy podatku, o której mowa w art. 87 ust. 1 ustawy.
Zatem skoro wskazali Państwo, że towary i usługi nabywane w ramach realizacji projektu będą wykorzystywane wyłącznie do czynności zwolnionych od podatku, to w sprawie nie ma również podstaw do analizowania możliwości częściowego odliczenia podatku naliczonego w trybie art. 90 ust. 1 i następne ustawy.
Tym samym stanowisko Państwa, w myśl którego nie będzie Państwu przysługiwało prawo do odliczenia podatku naliczonego od ww. wydatków według proporcji, o której mowa w art. 90 ustawy, ponieważ będą mieli Państwo możliwość bezpośredniego - obiektywnego i miarodajnego przypisania zakupu towarów i usług dotyczących opisanego projektu w całości do celów działalności zwolnionej, jest prawidłowe.
Dodatkowe informacje
Informacja o zakresie rozstrzygnięcia
Interpretacja dotyczy zdarzenia przyszłego, które Państwo przedstawili i stanu prawnego, który obowiązuje w dniu wydania interpretacji.
Wydana interpretacja dotyczy tylko sprawy będącej przedmiotem Państwa wniosku (zapytania). Inne kwestie, które nie zostały objęte pytaniem, nie mogą być – zgodnie z art. 14b § 1 Ordynacji podatkowej – rozpatrzone.
Jestem ściśle związany przedstawionym we wniosku opisem sprawy. Ponoszą Państwo ryzyko związane z ewentualnym błędnym lub nieprecyzyjnym jego przedstawieniem. Interpretacja indywidualna wywołuje skutki prawnopodatkowe tylko wtedy, o ile rzeczywisty stan sprawy będącej przedmiotem interpretacji pokrywał się będzie z opisem sprawy podanym przez Państwa w złożonym wniosku. Zatem, należy zaznaczyć, że wydając przedmiotową interpretację oparłem się na wynikającym z treści wniosku opisie sprawy. W konsekwencji w przypadku, gdy w toku postępowania podatkowego, kontroli podatkowej, bądź celno-skarbowej zostanie określony odmienny stan sprawy, interpretacja nie wywoła w tym zakresie skutków prawnych. Ponadto, w sytuacji zmiany któregokolwiek elementu przedstawionego we wniosku w opisie sprawy, udzielona odpowiedź traci swoją aktualność.
Pouczenie o funkcji ochronnej interpretacji
· Funkcję ochronną interpretacji indywidualnych określają przepisy art. 14k-14nb ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. – Ordynacja podatkowa (t.j. Dz.U. z 2025 r. poz. 111 ze zm.). Interpretacja będzie mogła pełnić funkcję ochronną, jeśli Państwa sytuacja będzie zgodna (tożsama) z opisem zdarzenia przyszłego i zastosują się Państwo do interpretacji.
· Zgodnie z art. 14na § 1 Ordynacji podatkowej:
Przepisów art. 14k-14n Ordynacji podatkowej nie stosuje się, jeśli stan faktyczny lub zdarzenie przyszłe będące przedmiotem interpretacji indywidualnej jest elementem czynności, które są przedmiotem decyzji wydanej:
1) z zastosowaniem art. 119a;
2) w związku z wystąpieniem nadużycia prawa, o którym mowa w art. 5 ust. 5 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług;
3) z zastosowaniem środków ograniczających umowne korzyści.
· Zgodnie z art. 14na § 2 Ordynacji podatkowej:
Przepisów art. 14k-14n nie stosuje się, jeżeli korzyść podatkowa, stwierdzona w decyzjach wymienionych w § 1, jest skutkiem zastosowania się do utrwalonej praktyki interpretacyjnej, interpretacji ogólnej lub objaśnień podatkowych.
Pouczenie o prawie do wniesienia skargi na interpretację
Mają Państwo prawo do zaskarżenia tej interpretacji indywidualnej do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego. Zasady zaskarżania interpretacji indywidualnych reguluje ustawa z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (t.j. Dz.U. z 2026 r. poz. 143 ze zm.; dalej jako „PPSA”).
Skargę do Sądu wnosi się za pośrednictwem Dyrektora KIS (art. 54 § 1 PPSA). Skargę należy wnieść w terminie trzydziestu dni od dnia doręczenia interpretacji indywidualnej (art. 53 § 1 PPSA):
· w formie papierowej, w dwóch egzemplarzach (oryginał i odpis) na adres: Krajowa Informacja Skarbowa, ul. Warszawska 5, 43-300 Bielsko-Biała (art. 47 § 1 PPSA), albo
· w formie dokumentu elektronicznego, w jednym egzemplarzu (bez odpisu), na adres Krajowej Informacji Skarbowej na platformie ePUAP: /KIS/wnioski albo /KIS/SkrytkaESP (art. 47 § 3 i art. 54 § 1a PPSA).
Skarga na interpretację indywidualną może opierać się wyłącznie na zarzucie naruszenia przepisów postępowania, dopuszczeniu się błędu wykładni lub niewłaściwej oceny co do zastosowania przepisu prawa materialnego. Sąd jest związany zarzutami skargi oraz powołaną podstawą prawną (art. 57a PPSA).
Podstawa prawna dla wydania interpretacji
Podstawą prawną dla wydania tej interpretacji jest art. 13 § 2a oraz art. 14b § 1 Ordynacji podatkowej.
QuickMap AI przeszukuje 2,87 mln dokumentów podatkowych i zwraca dopasowane orzeczenia z analizą linii orzeczniczej.
Wypróbuj za darmo