Uzasadnienie
1. Wyrok Sądu pierwszej instancji.
1.1. Zaskarżonym wyrokiem z 15 listopada 2023 r. (sygn. akt I SA/Kr 876/23), Wojewódzki Sąd Administracyjny w Krakowie (dalej: WSA, Sąd pierwszej instancji), oddalił skargę P. S.A. z siedzibą w A. (dalej: spółka, skarżąca) na decyzję Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Krakowie (dalej: DIAS, organ) z 1 sierpnia 2023 r. w przedmiocie odmowy wszczęcia postępowania w sprawie stwierdzenia nieważności decyzji (opisany wyrok i powołane w uzasadnieniu orzeczenia sądów administracyjnych dostępne są w internetowej bazie orzeczeń CBOSA).
1.2. W uzasadnieniu Sąd pierwszej instancji podał, że zaskarżoną decyzją z 1 sierpnia 2023 r. DIAS w Krakowie utrzymał w mocy decyzję własną z 18 maja 2023 r. w przedmiocie odmowy wszczęcia postępowania w sprawie stwierdzenia nieważności decyzji Naczelnika [...] Urzędu Celno-Skarbowego w K. z 8 września 2021r. określającej skarżącej wysokość zobowiązania podatkowego w podatku od towarów i usług za: lipiec 2016 r., wrzesień 2016 r., październik 2016 r. oraz wysokość nadwyżki podatku naliczonego nad podatkiem należnym w podatku od towarów i usług do obniżenia o tę różnicę kwoty podatku należnego za następne okresy rozliczeniowe za sierpień 2016 r.
Spółka złożyła wniosek o stwierdzenie nieważności decyzji Naczelnika [...] Urzędu Celno-Skarbowego w K. z 8 września 2021 r., od której złożyła odwołanie, a następnie skargę do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego. Jako przesłankę stwierdzenia nieważności decyzji podano art. 247 § 1 pkt 3 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2022 r. poz. 2651 z późn. zm.; dalej: O.p.). W ocenie skarżącej rażące naruszenie prawa polegało na tym, że "organ podatkowy nie dążył do wyjaśnienia stanu faktycznego, a zebrane zeznania miały udowodnić hipotezy stawiane przez organ". Ponadto – zdaniem skarżącej – organ podatkowy nie podjął niezbędnych działań w celu dokładnego wyjaśnienia stanu faktycznego oraz załatwienia sprawy tym samym naruszył przepisy art. 120, art. 122 i art. 187 O.p.
DIAS w Krakowie postanowieniem z 27 października 2022 r. zawiesił postępowanie w sprawie wniosku o stwierdzenie nieważności ww. decyzji.
Na skutek złożonego zażalenia, DIAS w Krakowie postanowieniem z 17 stycznia 2023 r. uchylił zaskarżone postanowienie i przekazał sprawę do ponownego rozpatrzenia. Głównym powodem uchylenia było niedostateczne wyjaśnienie, której decyzji (wydanej w I czy też w II instancji) dotyczy złożony wniosek o stwierdzenie nieważności.
W odpowiedzi na wezwanie organu, spółka wyraźnie wskazała, że wniosek o stwierdzenie nieważności decyzji dotyczy decyzji wydanej przez Naczelnika [...] Urzędu Celno-Skarbowego w K. w dniu 8 września 2021 r.
W związku z powyższym, DIAS w Krakowie decyzją z 18 maja 2023 r. odmówił wszczęcia postępowania w sprawie stwierdzenia nieważności ww. decyzji, bowiem decyzja ta nie jest ostateczna, a w związku z tym nie może być przedmiotem postępowania o stwierdzenie jej nieważności.
Pismem z 31 maja 2023 r. spółka złożyła odwołanie, zarzucając, że w sprawie tej nie zachodzą przesłanki do odmowy wszczęcia postępowania w sprawie stwierdzenia nieważności decyzji bowiem jest ona ostateczna, a organ podatkowy ma obowiązek rozpoznać żądanie strony.
Po rozpatrzeniu odwołania DIAS w Krakowie wydał opisaną na wstępie decyzję z 1 sierpnia 2023 r. Organ podkreślił, że jeśli decyzja objęta wnioskiem o stwierdzenie nieważności nie jest czy nie była ostateczna, jest to wystarczający i w pełni samodzielny powód do wydania decyzji o odmowie wszczęcia postępowania w tym przedmiocie.
1.3. Sąd pierwszej instancji oddalając skargę podkreślił, że w rozpatrywanej sprawie decyzja Naczelnika [...] Urzędu Celno-Skarbowego w K. z dnia 8 września 2021 r. nie może być zasadnie uznana za ostateczną, skoro w wyniku odwołania została ona utrzymana decyzją z 21 kwietnia 2022 r. w mocy, a następnie zaskarżona do Sądu (sprawa I SA/Kr 622/22 – nieprawomocny wyrok z dnia 7 grudnia 2022 r.).
W ocenie Sądu, nie ulega wątpliwości, że decyzja, która nie ma przymiotu ostateczności, nie może być przedmiotem postępowania w sprawie stwierdzenia nieważności ani na wniosek, ani z urzędu. W ocenie Sądu, organ trafnie zastosował art. 249 § 1 O.p. i mocą kontrolowanej decyzji odmówił podatnikowi wszczęcia postępowania w sprawie stwierdzenia nieważności decyzji opisanej we wniosku, która nie była decyzją ostateczną. Dodatkowo Sąd pierwszej instancji zwrócił uwagę, że przedmiotem kontroli jest decyzja organu odmawiająca wszczęcia postępowania w sprawie stwierdzenia nieważności decyzji, która nie jest rozstrzygnięciem co do meritum. W rozpoznanej sprawie organy nie zbierały dowodów, nie przeprowadzały postępowania merytorycznego i decyzje w pierwszej i drugiej instancji wydały po rozpoznaniu wniosku o wszczęcie postępowania w trybie nadzwyczajnym, który to tryb nie mógł być uruchomiony z uwagi na brak przymiotu ostateczności decyzji objętej wnioskiem. Oznacza to, że pomimo niewykonania przez organ pierwszej instancji obowiązku określonego przez art. 200 § 1 O.p. nie stanowiło to w realiach tej sprawy uchybienia, które mogłoby mieć wpływ na rozstrzygnięcie.
Mając powyższe na uwadze, Sąd pierwszej instancji działając na podstawie art. 151 ustawy z dnia 30 sierpnia 2002r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (Dz.U. z 2023 r. poz. 259 z późn. zm.; dalej: P.p.s.a.), skargę oddalił.
2. Skarga kasacyjna.
2.1. We wniesionej skardze kasacyjnej, spółka zaskarżyła powyższe orzeczenie w całości, formułując zarzuty naruszenia przez Sąd I instancji przepisów:
I. prawa procesowego, które miało istotny wpływ na wynik sprawy, a mianowicie:
1) art. 151 P.p.s.a. w związku z art. 248 § 1 O.p. poprzez oddalenie skargi i tym samym uznanie przez Sąd I instancji, że przedmiotem wniosku w sprawie stwierdzenia nieważności decyzji może być tylko decyzja ostateczna w sytuacji, gdy przepis art. 248 § 1 O.p. nie stanowi o stwierdzeniu nieważności decyzji wyłącznie mającej przymiot ostatecznej;
2) art. 151 P.p.s.a. w zw. z art. 124 O.p. w zw. z art. 210 § 1 pkt 6 O.p. poprzez oddalenie skargi i tym samym uznanie, że organ podatkowy wyjaśnił zasadność przesłanek, którymi kierował się przy załatwianiu sprawy w sytuacji, gdy organ podatkowy dopuścił się uchybień w zakresie uzasadnienia faktycznego i prawnego poprzez jedynie lakoniczne stwierdzenie, że postępowanie w sprawie stwierdzenia nieważności decyzji nie może być wszczęte zaniechując odniesienia się do okoliczności podnoszonych przez skarżącego kasacyjnie;
3) art. 151 P.p.s.a. w zw. z art. 122 O.p. w zw. z art. 187 § 1 O.p. w zw. z art. 216 § 1 O.p. poprzez oddalenie skargi i tym samym uznanie, że organ podatkowy podjął konieczne działania zmierzające do dokładnego wyjaśnienia stanu faktycznego oraz wyczerpującego zebrania i rozpatrzenia materiału dowodowego, a następnie analizował udowodnienie danych okoliczności na podstawie całokształtu materiału dowodowego w sposób wnikliwy i rzetelny w sytuacji, gdy organ podatkowy nie przeprowadził wnioskowanego przez Skarżącego kasacyjnie dowodu z zeznań świadka w osobie T. M. i B. W. na okoliczności istotne z punktu widzenia rozstrzygnięcia niniejszej sprawy to jest, czy spółka dochowała należytej staranności w VAT oraz dodatkowe ustalenie prawidłowego stanu faktycznego. W zeznaniach w postępowaniu podatkowym będącym przedmiotem wniosku o stwierdzenie nieważności decyzji są one ze sobą sprzeczne, a co więcej zaniechał wydania postanowienia o odmowie przeprowadzenia dowodu z zeznań świadka w osobie T. M. i B. W.;