Uzasadnienie
1. Zaskarżonym wyrokiem z 19 grudnia 2024 r., sygn. akt III SAB/Wa 34/24 Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie (dalej: "WSA", "Sąd pierwszej instancji"), działając na podstawie art. 149 § 1 pkt 3 oraz § 1a ustawy z dnia 30 sierpnia 2002r. - Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (t.j. Dz.U. z 2023 r. poz. 1634 ze zm., dalej jako: "P.p.s.a."), w sprawie ze skargi O. sp. z o.o. z siedzibą w W. (dalej: "Spółka", "Skarżąca", "Strona") stwierdził, że Dyrektor Izby Administracji Skarbowej w Warszawie (dalej: "DIAS", "organ odwoławczy", "organ drugiej instancji") dopuścił się przewlekłego prowadzenia postępowania, które miało miejsce z rażącym naruszeniem prawa; umorzył postępowanie w zakresie zobowiązania organu do wydania decyzji oraz wymierzył Dyrektorowi Izby Administracji Skarbowej w Warszawie grzywnę w wysokości 3.000 zł.
Wskazany wyrok i inne orzeczenia sądów administracyjnych powołane w niniejszym uzasadnieniu są dostępne w internetowej Centralnej Bazie Orzeczeń Sądów Administracyjnych, dalej zwanej też CBOSA, pod adresem "orzeczenia.nsa.gov.pl".
2.1. Rozstrzygnięcie zapadło w następującym stanie faktycznym. Naczelnik Urzędu Skarbowego Warszawa-Ursynów (dalej: "organ pierwszej instancji" lub "NUS") decyzją z 16 lipca 2021 r., określił Spółce, za kwiecień i maj 2019 r., przybliżoną kwotę nadwyżki podatku naliczonego nad podatkiem należnym, przybliżoną kwotę zawyżenia zwrotu podatku od towarów i usług wraz z odsetkami za zwłokę oraz przybliżoną kwotę dodatkowego zobowiązania w podatku od towarów i usług. Naczelnik orzekł nadto o zabezpieczeniu kwot na majątku Skarżącej przed wydaniem decyzji określającej wysokość zwrotu podatku oraz ustalającej dodatkowe zobowiązanie w podatku od towarów i usług. DIAS decyzją z 28 lutego 2022 r., utrzymał w mocy decyzję z 16 lipca 2021 r. Na powyższą decyzję Spółka złożyła skargę do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie, który wyrokiem z 28 października 2022 r., sygn. akt III SA/Wa 1087/22, uchylił decyzję DIAS. Sąd wskazał, że dopóki organ podatkowy dysponuje kwotą zadeklarowanego zwrotu podatku od towarów i usług, dopóty nie ma podstaw do wydawania decyzji o zabezpieczeniu, albowiem nie ma obawy niewykonania zobowiązania podatkowego w rozumieniu art. 33 § 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (dalej "O.p."). Naczelny Sąd Administracyjny, wyrokiem z 14 lipca 2023 r., sygn. akt I FSK 483/23, oddalił skargę kasacyjną DIAS. NSA uznał, że nie istniały podstawy do zabezpieczenia kwoty zwrotu nadwyżki podatku w sytuacji, gdy zwrot taki nie został dokonany na rzecz Spółki ani nie został zarachowany na poczet jej zaległości podatkowych.
Prawomocny wyrok wraz z aktami sprawy wpłynął do Izby Administracji Skarbowej w Warszawie 13 grudnia 2023 r. Pismem z 3 stycznia 2024 r. DIAS zwrócił się do NUS z prośbą o wskazanie stanu zaległości Spółki. W dniu 5 stycznia 2024 r. DIAS zwrócił się do NUS o informację w zakresie etapu prowadzonego postępowania podatkowego (wymiarowego), ewentualnie o przekazanie kserokopii decyzji wymiarowej w przypadku jej wydania. W odpowiedzi pismem z 9 stycznia 2024 r., poinformowano, że postępowanie w sprawie prawidłowego rozliczenia podatku od towarów i usług za miesiące od marca do lipca 2019 r. pozostaje w toku, a w piśmie z 11 stycznia 2024 r. wskazał, że Spółka posiada wymagalne zaległości podatkowe z tytułu podatku od towarów i usług. DIAS wielokrotnie powtarzał te zapytania do NUS i wyznaczał nowe terminy załatwienia sprawy.
W dniu 24 maja 2024 r. pełnomocnik Skarżącej wniósł do Szefa Krajowej Administracji Skarbowej ponaglenie na bezczynność organu odwoławczego. Ponaglenie to zostało rozpatrzone (uznano je za bezprzedmiotowe).
Pismem z 27 maja 2024 r. DIAS zwrócił się do NUS o przesłanie kserokopii decyzji wymiarowej w przedmiocie określenia wysokości zobowiązania podatkowego w podatku od towarów i usług miesiące od kwietnia do maja 2019 r. oraz potwierdzenia doręczenia tej decyzji.
DIAS, decyzją z 7 czerwca 2024 r., umorzył postępowanie odwoławcze w sprawie zabezpieczenia.
2.2. W dniu 27 maja 2024 r. Spółka wniosła skargę na "(....) bezczynność Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Warszawie w związku z niewykonaniem wyroku Naczelnego Sądu Administracyjnego z dnia 14 lipca 2023 roku, sygn. akt I FSK 483/23.". W skardze wskazano, że pomimo ponaglenia DIAS pozostaje w zwłoce z wykonaniem wyroków sądowych.
2.3. DIAS w odpowiedzi na skargę wniósł o jej oddalenie oraz wskazał na podjęte czynności wyjaśniające przebieg postępowania wymiarowego oraz stan zaległości Spółki, a w końcu na wydanie żądanej decyzji.
2.4. Pismem z 14 czerwca 2024 r. do sprawy przystąpił Rzecznik Małych i Średnich Przedsiębiorców. Rzecznik przyłączył się do skargi i w całości poparł argumentację Skarżącej.
2.5. Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie uznał skargę za zasadną w zakresie przewlekłości postępowania odwoławczego DIAS. W ocenie Sądu pierwszej instancji wobec jednoznacznego i jasnego stanowiska Sądów obu instancji zbędne było prowadzenie jakiegokolwiek postępowania dowodowego, zaś obowiązkiem DIAS, w świetle art. 153 P.p.s.a., było jedynie uchylenie decyzji NUS i umorzenie postępowania podatkowego w zakresie określenia przybliżonych kwot zobowiązań (zawyżenia zwrotu) oraz zabezpieczenia tych kwot na majątku Spółki, a nadto zabezpieczenia odsetek za zwłokę. Ponadto w grudniu 2013 r., kiedy Dyrektor otrzymał akta sprawy po wyroku NSA, w obrocie prawnym już istniała uchwała tego Sądu z 29 maja 2023 r. o sygn. I FPS 1/23, w której wykluczono zabezpieczenie tzw. sankcji VAT. Nie istniał więc żaden zakres decyzji NUS, który mógłby zostać utrzymany w mocy w odwoławczej decyzji Dyrektora, co ponownie potwierdza zbędność jakiegokolwiek postępowania dowodowego. Mimo tego DIAS przez kolejne miesiące zwlekał z wydaniem swojej decyzji odwoławczej, najwyraźniej oczekując, że po wydaniu decyzji wymiarowej uzyska podstawę do zakończenia postępowania zabezpieczającego w sposób formalny, tj. poprzez umorzenie postępowania odwoławczego bez wyrażenia swojej oceny legalności decyzji zabezpieczającej.