Uzasadnienie
1. Przedmiot skargi kasacyjnej i dalsze czynności procesowe.
1.1. J. S. (dalej: Skarżąca) pismem z dnia 28 lutego 2022 r. wniosła skargę kasacyjną od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Lublinie z dnia 26 listopada 2021 r., sygn. akt I SA/Lu 520/21.
1.2. Zaskarżonym wyrokiem Sąd uwzględnił skargę Skarżącej i uchylił decyzję Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Lublinie (dalej: Dyrektor IAS) z dnia 28 października 2020 r., którą utrzymana została w mocy decyzja Naczelnika Urzędu Skarbowego w O. z dnia 4 lutego 2020 r. w przedmiocie podatku od towarów i usług (dalej: podatek VAT) za poszczególne miesiące od stycznia do grudnia 2013 r. Uchylenie decyzji Dyrektora IAS nastąpiło na podstawie art. 145 § 1 pkt 1 lit. c ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. - Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (Dz. U. z 2019 r. poz. 2325, z późn. zm.; dalej: P.p.s.a.).
Sąd pierwszej instancji stwierdził, że zasadnicze znaczenie dla takiego rozstrzygnięcia miała kwestia niedostatecznego wyjaśnienia przez organ podatkowy niektórych okoliczności niezbędnych do zawieszenia biegu terminu przedawnienia zobowiązań Skarżącej w podatku VAT za podane okresy rozliczeniowe.
Dyrektor IAS powołał się bowiem tylko na wystąpienie sformalizowanych warunków zawieszenia biegu terminu przedawnienia na podstawie art. 70 § 6 pkt 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2020 r. poz. 1325, z późn. zm.; dalej: O.p.). W tym przypadku było to wszczęcie w dniu 15 października 2018 r. postępowania w sprawie o przestępstwa skarbowe mające związek z niewykonaniem zobowiązań objętych zaskarżoną decyzją (tj. dochodzenia [...]) i zawiadomienie Skarżącej przez Naczelnika US w dniu 2 listopada 2018 r. o zawieszeniu biegu terminu przedawnienia z tego powodu.
Natomiast, zważywszy na uchwałę Naczelnego Sądu Administracyjnego z dnia 24 maja 2021 r., sygn. akt I FPS 1/21, niezbędne było również wykazanie braku instrumentalności wszczęcia wspomnianego postępowania karnego skarbowego i danie temu odpowiedniego wyrazu w uzasadnieniu wydanej decyzji, zważywszy na okoliczności niniejszego przypadku, a tych elementów zabrakło.
1.3. Obok powyższego w wyroku objętym skargą kasacyjną Sąd (w motywach uzasadnienia przedstawionych przed problematyką dotyczącą przedawnienia) wyraził najpierw stanowisko co do meritum sprawy podatkowej, czyli ustaleń i ocen prawnych organu w zakresie zawyżenia przez Skarżącą podatku naliczonego i zaniżenia podatku należnego w poszczególnych okresach rozliczeniowych z 2013 r.
Mianowicie w tym obszarze stwierdził, że: 1) zasadnie pozbawiono Skarżącą prawa do odliczenia podatku naliczonego z faktur wystawionych przez [...], jako tych, które nie dokumentowały rzeczywistych zdarzeń gospodarczych; 2) prawidłowo przyjęto, że Skarżąca nie zaewidencjonowała w sposób pełny dokonanej sprzedaży.
Według oceny sądowej na tym polu organy nie naruszyły przepisów procesowych dotyczących zasad ogólnych postępowania podatkowego, gromadzenia i oceny dowodów, a to art. 120, art. 121, art. 122, art. 123 § 1, art. 127, art. 180, art. 181 i art. 187 § 1 O.p., jak również prawa materialnego w płaszczyźnie wyłączenia prawa do odliczenia z zakwestionowanych faktur, czyli zastosowania art. 88 ust. 3a pkt 4 lit. a ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (w brzmieniu właściwym dla 2013 r.; dalej: u.p.t.u.), oraz zwiększenia wolumenu sprzedaży.
1.4. W skardze kasacyjnej wniesionej od całości wyroku Skarżąca zarzuciła Sądowi naruszenie w pierwszej kolejności:
1) art. 145 § 1 pkt 1 lit. c P.p.s.a. przez uchybienie art. 3 § 1 i § 2 P.p.s.a. w związku z art. 1 § 1 i § 2 ustawy z dnia 25 lipca 2002 r. - Prawo o ustroju sądów administracyjnych (Dz. U. z 2021 r. poz. 137, z późn. zm.; dalej: P.u.s.a.) oraz art. 141 § 4 P.p.s.a. w związku z art. 210 § 1 pkt 6 w związku z § 4 O.p. na skutek dokonania w zaskarżonym wyroku [również] merytorycznej oceny sprawy podatkowej w zakresie rozliczenia podatku VAT przez Skarżącą za poszczególne miesiące 2013 r. w sytuacji, gdy - jak przyjął Sąd (s. 20-24 wyroku) - organ podatkowy nie wykazał w uzasadnieniu decyzji w sposób prawidłowy, że zobowiązania podatkowe Skarżącej w podatku VAT za wspomniane okresy rozliczeniowe nie uległy przedawnieniu [na zasadzie art. 70 § 1 O.p., gdyż doszło do zawieszenia biegu terminu przedawnienia na podstawie art. 70 § 6 pkt 1 w związku z art. 70c O.p.];
Tymczasem oczywistym powinno być, że [ewentualne] przedawnienie zobowiązań podatkowych w podatku VAT za poszczególne miesiące 2013 r. czyniłoby bezprzedmiotowym merytoryczną kontrolę takich rozliczeń w podatku VAT.
W razie zaś nieuwzględnienia tego zarzutu Skarżąca dodatkowo zarzuciła Sądowi pierwszej instancji naruszenie:
2) art. 145 § 1 pkt 1 lit. a P.p.s.a. przez uchybienie art. 86 ust. 1 i ust. 2 pkt 1 lit. a w związku z art. 88 ust. 3a pkt 4 lit. a, art. 99 ust. 12 oraz art. 106 ust. 1 u.p.t.u. w związku z art. 70 § 1 i § 6 pkt 1 w związku z art. 70c O.p. w związku z art. 3 § 1 i § 2 P.p.s.a. w związku z art. 1 § 1 i § 2 P.u.s.a. oraz art. 141 § 4 P.p.s.a. na skutek zaakceptowania błędnego ustalenia, że Skarżącej nie przysługiwało prawo do odliczenia podatku VAT z faktur wystawionych przez [...] jako dokumentujących nabycia niezwiązane z działalnością gospodarczą Skarżącej albo czynności, które nie zostały faktycznie wykonane, a to w wyniku przeprowadzenia wadliwej kontroli legalności zaskarżonej decyzji poprzez podjęcie próby kontroli jej merytorycznego rozstrzygnięcia przed dokonaniem oceny wystąpienia w tej sprawie przesłanki przedawnienia zobowiązań Skarżącej w podatku VAT za poszczególne okresy rozliczeniowe od stycznia do grudnia 2013 r., a więc przed oceną najdalej idącej przesłanki warunkującej możliwość dalszego orzekania w sprawie podatkowej;
3) art. 145 § 1 pkt 1 lit. c P.p.s.a. przez uchybienie:
a) art. 70 § 1 § 6 pkt 1 w związku z art. 70c O.p. w związku z art. 3 § 1 i § 2 P.p.s.a. w związku z art. 1 § 1 i § 2 P.u.s.a. oraz art. 141 § 4 P.p.s.a. na skutek błędnej wykładni przepisów prawa materialnego dotyczących przedawnienia zobowiązań podatkowych, która doprowadziła do wadliwej kontroli legalności zaskarżonej decyzji przejawiającej się dokonaniem w [uzasadnieniu] wyroku oceny wystąpienia w sprawie podatkowej przesłanki przedawnienia zobowiązań Skarżącej w podatku VAT za poszczególne miesiące 2013 r. dopiero po [przedstawieniu] merytorycznej kontroli rozstrzygnięcia zawartego w zaskarżonej decyzji, w sytuacji, gdy prawidłowym rozstrzygnięciem powinna być przede wszystkim ocena wystąpienia przesłanki przedawnienia tych zobowiązań, która to przesłanka warunkuje możliwość orzekania w tej sprawie, bez dalszego dokonywania kontroli merytorycznego rozstrzygnięcia zawartego w zaskarżonej decyzji z uwagi na bezprzedmiotowość postępowania w przypadku przedawnienia zobowiązań;