Uzasadnienie
1. Wyrok Sądu pierwszej instancji.
1.1. Zaskarżonym wyrokiem z dnia 6 grudnia 2021 r., sygn. akt III SA/Wa 599/21, Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie po rozpoznaniu skargi A. sp. z o.o. w W. (dalej: Strona, Spółka lub Skarżąca) na decyzję Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Warszawie (dalej: organ drugiej instancji lub DIAS) z dnia 18 grudnia 2020 r. w przedmiocie odmowy uchylenia decyzji ostatecznej w sprawie podatku od towarów i usług za miesiące od października do grudnia 2009 r., działając na podstawie art. 151 ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (t.j. Dz. U. z 2019 r., poz. 2325, ze zm., dalej: p.p.s.a.), oddalił skargę (opisany wyrok i powołane w uzasadnieniu orzeczenia sądów administracyjnych dostępne są na: www.orzeczenia.nsa.gov.pl).
1.2. WSA zgodził się z organem drugiej instancji co do braku podstaw do uchylenia decyzji ostatecznej, po wznowieniu postępowania, na wniosek oparty na podstawie art. 240 § 1 pkt 11 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (t.j. Dz. U. z 2020 r. poz. 1325 ze zm., dalej: Ordynacja podatkowa).
2. Skarga kasacyjna.
2.1. Skargę kasacyjną od powyższego wyroku wniosła Strona, zaskarżając wyrok w całości. Na podstawie art. 174 pkt 2 p.p.s.a. zarzucono naruszenie:
I. art. 145 § 1 pkt 1 lit. c) p.p.s.a. w zw. z art. 245 § 1 pkt 2 w zw. z art. 240 § 1 pkt 11 Ordynacji podatkowej, polegające na odmowie uchylenia zaskarżonej decyzji mimo, iż na podst. art. 245 § 1 pkt 1 w zw. z art. 240 § 1 pkt 11 Ordynacji podatkowej decyzję należało uchylić;
II. art. 145 § 1 pkt 1 lit. a)-c) w zw. z art. 134 § 1 p.p.s.a. w zw. z art. 180 § 1, art. 181, art. 187 § 1, art. 191 Ordynacji podatkowej w zw. z art. 47 Karty praw podstawowych Unii Europejskiej w zw. z art. 86 ust. 1 oraz art. 88 ust. 3a pkt. 4 lit. a) ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (t.j. Dz. U. z 2021 r. poz. 685, ze zm., dalej: ustawa o VAT) polegające na nieuchyleniu zaskarżonej decyzji mimo, że WSA nie miał możliwości skontrolować czy materiał dowodowy zgromadzony w innych postępowaniach, a nie włączony do akt sprawy spółki A.1 Sp. z o.o. mógł wpłynąć na wynik tej sprawy, a w szczególności czy mógł być źródłem materiału, który Spółka mogłaby wykorzystać na swoją obronę, dowodząc, że działa zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT, a art. 88 ust. 3a pkt. 4 lit. a) nie znajduje zastosowania;
III. art. 145 § 1 pkt 1 lit. c) w zw. z art. 134 § 1 p.p.s.a. w zw. z art. 200 § 1 w zw. z art. 192 Ordynacji podatkowej w zw. z art. 47 Karty praw podstawowych Unii Europejskiej, polegające na nieuchyleniu zaskarżonej decyzji mimo, że organy z urzędu nie zagwarantowały dostępu do wykorzystanych w sprawie akt pochodzących z innych postępowań administracyjnych, przez co Spółka faktycznie nie mogła wypowiedzieć się w zakresie całego dostępnego materiału dowodowego.
2.2. Organ w odpowiedzi na skargę kasacyjną wniósł o jej oddalenie oraz o zasądzenie kosztów postępowania kasacyjnego, w tym kosztów zastępstwa procesowego według norm prawem przepisanych.
3. Naczelny Sąd Administracyjny zważył, co następuje.
3.1. Zarzuty skargi kasacyjnej nie mają usprawiedliwionych podstaw, dlatego skarga kasacyjna podlega oddaleniu.
3.2. Postawione w skardze kasacyjnej zarzuty dotyczą naruszenia prawa procesowego. Ta ich część, która mogła zostać uznana potencjalnie za istotną dla wyniku sprawy, odnosiła się do zagadnienia spornego dotyczącego odczytania przez DIAS i następnie Sąd pierwszej instancji - zdaniem Skarżącej wadliwie - sensu i znaczenia wyroku Trybunału Sprawiedliwości Unii Europejskiej (dalej: TSUE) z dnia 16 października 2019 r., C-189/18 w sprawie [...] (dalej: wyrok [...]), na tle sprawy z jej wniosku o wznowienie postępowania podatkowego zakończonego decyzją wymiarową (ostateczną i prawomocną) w przedmiocie podatku VAT.
Na tle tej problematyki w skardze kasacyjnej podniesiono zastrzeżenia dotyczące wadliwego wyrokowania poprzez brak uwzględnienia skargi na podstawie art. 145 § 1 pkt 1 lit. c p.p.s.a. Zarzuty kasacyjne zbudowane wokół wymienionych wcześniej przepisów Ordynacji podatkowej z zakresu wznowienia postępowania podatkowego, ale również przepisów ustawy o VAT, odnosiły się do zaskarżonej decyzji (wydanej we wznowionym postępowaniu) jak i dostępu do materiału dowodowego w postępowaniu wymiarowym. Natomiast uzasadnienie zarzutów skargi kasacyjnej sprowadza się niemal w całości do ogólnej polemiki Skarżącej z uzasadnieniem wyroku WSA w części dotyczącej precedensowego charakteru wymienionego wyżej wyroku TSUE.
3.3. Istotą problemu w rozpatrywanej sprawie było ustalanie czy, w świetle art. 240 § 1 pkt 11 Ordynacji podatkowej, wyrok w sprawie [...] miał wpływ na treść ostatecznej decyzji wymiarowej wydanej wobec Spółki.
W ocenie Naczelnego Sądu Administracyjnego Sąd pierwszej instancji zasadnie zaakceptował pogląd organu, że w kontrolowanej sprawie nie wystąpiła przesłanka uchylenia decyzji ostatecznej, po wznowieniu postępowania z przyczyny wymienionej w art. 240 § 1 pkt 11 Ordynacji podatkowej, a powołany wyrok TSUE z dnia 16 października 2019 r. sygn. akt C-189/18 nie ma wpływu na rozstrzygnięcie w sprawie.
3.4. Zgodnie z treścią art. 240 § 1 pkt 11 Ordynacji podatkowej, w sprawie zakończonej decyzją ostateczną wznawia się postępowanie, jeżeli orzeczenie Trybunału Sprawiedliwości Unii Europejskiej ma wpływ na treść wydanej decyzji. Wpływ orzeczenia TSUE na decyzję podatkową zachodzi wówczas, gdy orzeczenie to oddziałuje na nią w sposób na tyle istotny, że wymusza odmienne rozstrzygnięcie sprawy podatkowej od przyjętego w decyzji ostatecznej. Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku z dnia 29 września 2016 r., sygn. akt I FSK 477/15 przesądził, że przepis art. 240 § 1 pkt 11 Ordynacji podatkowej, należy rozumieć w ten sposób, że jego przedmiotem jest orzeczenie TSUE, które jako precedensowe wskazuje na wykładnię określonych norm prawa unijnego, rzutujących na praktykę przepisów krajowych, stanowiących podstawę wydania decyzji, będącej przedmiotem wniosku o wznowienie postępowania.