Uzasadnienie
1. Wyrok Sądu pierwszej instancji.
1.1. Zaskarżonym wyrokiem z dnia 23 stycznia 2025 r. r. sygn. akt III SA/Wa 2422/24 Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie po rozpoznaniu skargi I. sp. k. z siedzibą w W. (dalej: Skarżąca, Strona) na decyzję Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Warszawie (dalej: DIAS, organ drugiej instancji) z dnia 28 sierpnia 2024 r. w przedmiocie podatku od towarów i usług za październik 2018 r., działając na podstawie z art. 145 § 1 pkt 1 lit. a) i c) ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (Dz.U. z 2024 r. poz. 935 ze zm., dalej: p.p.s.a.), uchylił zaskarżoną decyzję (opisany wyrok i powołane w uzasadnieniu orzeczenia sądów administracyjnych dostępne są na: www.orzeczenia.nsa.gov.pl).
1.2. Z uzasadnienia zaskarżonego wyroku wynika, że w dniu 8 listopada 2018r. do Naczelnika Urzędu Skarbowego w [...] (dalej: NUS) wpłynęła złożona przez Spółkę deklaracja VAT-7 za październik 2018 r. z wykazaną kwotą nadwyżki podatku naliczonego nad należnym w wysokości 571.000 zł do zwrotu na rachunek bankowy w terminie 25 dni, tj. do 3 grudnia 2018 r. oraz kwotą do przeniesienia na następny okres rozliczeniowy w wysokości 2.774 zł. Badanie zasadności ww. zwrotu było przedmiotem kontroli podatkowej zakończonej doręczeniem protokołu kontroli w dniu 16 kwietnia 2021 r., w którym stwierdzono nieprawidłowości. NUS wszczął postępowanie podatkowe w sprawie rozliczenia podatku VAT i decyzją z dnia 21 listopada 2022 r. określił Skarżącej kwotę zwrotu podatku w wysokości 462.177 zł. Decyzja organu pierwszej instancji została następnie utrzymana w mocy przez DIAS decyzją z dnia 2 marca 2023 r. Na to rozstrzygnięcie Strona złożyła skargę do WSA, który wyrokiem z dnia 19 października 2023 r., sygn. akt III SA/Wa 1175/23 uchylił decyzje organów obu instancji oraz umorzył postępowanie administracyjne.