Uzasadnienie
1. Wyrok Sądu pierwszej instancji.
1.1. Zaskarżonym wyrokiem z 28 lutego 2025 r., sygn. akt III SA/Wa 2035/24 Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie po rozpoznaniu skargi J.S. (dalej: Skarżący, Podatnik) na decyzję Dyrektora Izby Administracji Skarbowej
w Warszawie (dalej: Organ drugiej instancji, DIAS) z 24 lipca 2024 r. w przedmiocie podatku od towarów i usług za poszczególne okresy rozliczeniowe 2019 r., uchylił zaskarżoną decyzję i zasądził od DIAS na rzecz Skarżącego zwrot kosztów postępowania sądowego.
1.2. Sąd pierwszej instancji przedstawił następujący stan faktyczny sprawy.
Naczelnik Mazowieckiego Urzędu Celno-Skarbowego w Warszawie (dalej: NUCS) decyzją z 23 maja 2024 r. określił Skarżącemu, prowadzącemu działalność gospodarczą pod nazwą S., kwoty zobowiązań podatkowych w podatku od towarów i usług za miesiące od stycznia do maja 2019 r., lipiec 2019 r. i miesiące od września do grudnia 2019 r., kwoty nadwyżki podatku naliczonego nad należnym do przeniesienia na następny okres rozliczeniowy za styczeń i czerwiec 2019 r. i umorzył postępowanie za sierpień 2019 r. DIAS ww. decyzją z 24 lipca 2024 r. utrzymał w mocy ww. decyzję NUCS z 23 maja 2024 r.
Organy podatkowe stanęły na stanowisku, że w świetle art. 86 ust. 1, ust. 2 pkt 1 lit. a i art. 88 ust. 3a pkt 4 lit. a ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. z 2025 r. poz. 775 ze zm., dalej: u.p.t.u.) Skarżący dokonał nieuprawnionego obniżenia podatku należnego o kwotę podatku naliczonego wynikającego z faktur dokumentujących transakcje nabycia palet i elementów drewnianych od 4. Sp. z o.o. i Z. Sp. z o.o. Faktury VAT wystawione przez te podmioty nie stanowią podstawy do obniżenia podatku należnego oraz zwrotu różnicy podatku lub zwrotu podatku naliczonego, ponieważ nie dokumentują rzeczywistych zdarzeń gospodarczych, a Skarżący nie zachował należytej staranności przy wyborze kontrahentów.
1.3. Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie zaskarżonym wyrokiem uchylił decyzję DIAS.
W uzasadnieniu wskazał, że skarga jest zasadna. Wyjaśnił, że strony spierają się o prawo Skarżącego do odliczenia podatku naliczonego wykazanego w fakturach VAT wystawionych przez 4. Sp. z o.o. i Z. Sp. z o.o. Organy podatkowe nie kwestionują, że Skarżący nabył i sprzedał towar (palety), ale uważają, że towar ten nie mógł pochodzić od wystawców faktur, ponieważ ci nie prowadzili rzeczywistej działalności gospodarczej.
Wskazał, że kurs obrany przez organy podatkowe jest problematyczny z dwóch powodów. Po pierwsze, organy podatkowe nie wyjaśniają, dlaczego uważają dostawy fakturowane przez te podmioty za realne. Sąd powołując się na zeznania P.W. stwierdził, iż wynika z nich, że w pewnej mierze 4. Sp. z o.o. i Z. Sp. z o.o. rzeczywiście dysponowały towarami. Natomiast organy podatkowe nie pogłębiły tego wątku. Po drugie rozważania dotyczące braku dobrej wiary Skarżącego są nieprzekonujące. Z jednej strony rzeczywiście nie prowadził on żadnej pogłębionej weryfikacji kontrahentów i rzeczywiście przesłuchiwany w charakterze strony nie dostarczył w pełni wysyconego szczegółem obrazu współpracy z 4. Sp. z o.o. i Z. Sp. z o.o., a z drugiej strony podczas przesłuchania przytoczył jednak istotne okoliczności tej współpracy, m.in. powołał się na znajomość z P.W., a okoliczności te dobrze wpisują się w model jego działalności.
Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie nie podziela zarzutów i ocen, że Skarżący "nie sporządzał pisemnych umów regulujących współpracę z dostawcami towarów oraz nie ustalał tak istotnych kwestii, jak warunki dostawy towarów, prawa i obowiązki stron, czy warunki reklamacji. Nie sporządzano również pisemnych zamówień ani protokołów odbioru towarów" (s. 33 zaskarżonej decyzji), że nie przejawiał "zachowań rynkowych (...), polegających na podejmowaniu inicjatywy w pozyskiwaniu kontrahentów", gdyż "[w] normalnych warunkach rynkowych podmiot gospodarczy wyszukuje kontrahentów, dokonuje wyboru najbardziej korzystnej oferty w celu maksymalizacji zysków", a w sprawie "Strona takiej inicjatywy nie podejmowała, poprzestając na zawieraniu transakcji z podmiotem, który sam się do niej zgłosił" (tamże), czy też, że "[n]ie przedstawił pisemnych zamówień, protokołów odbioru, ani korespondencji handlowej dokumentującej przedmiotowe transakcje" (s. 36 zaskarżonej decyzji). Wyjaśnił, że zarzuty te i oceny są nadmiernie rygorystyczne i oderwane od realiów rynkowych.
Sąd uważa za znaczące to, że za okresy objęte zaskarżoną decyzją Skarżący zasadniczo deklarował podatek do zapłaty w znacznych wartościach. Jego rozliczenie w VAT wypadało się zasadniczo in plus – co sugeruje, że nie korzystał z "fabryki faktur".
2. Skarga kasacyjna.
2.1. Od powyższego wyroku skargę kasacyjną wywiódł DIAS.
2.1.1. Na podstawie art. 174 pkt 1 ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (Dz. U. z 2024 r. poz. 935 ze zm., dalej: p.p.s.a.), zarzucił naruszenie przepisów prawa materialnego, tj. art. 88 ust. 3a pkt 4 lit. a u.p.t.u., poprzez jego niezastosowanie, pomimo że okoliczności sprawy uzasadniały stanowisko organów podatkowych, że faktury stwierdzały czynności, które nie zostały dokonane i jako takie nie mogą stanowić podstawy obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku VAT w nich naliczonego.
2.1.2. Na podstawie art. 174 pkt 2 zarzucił naruszenie przepisów postępowania, tj.:
1) art. 145 § 1 pkt 1 lit. c p.p.s.a. w powiązaniu z art. 3 § 1 p.p.s.a i art. 3 § 2 pkt 1 p.p.s.a. w zw. z art. 122 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2025 r. poz. 111 ze zm., dalej o.p.), art. 187 § 1 o.p., art. 191 o.p., poprzez dokonanie nieprawidłowej kontroli decyzji i w konsekwencji niezasadne jej uchylenie, na skutek wadliwego przyjęcia przez Sąd, że w obecnym stanie sprawy w oparciu o zgromadzony dotychczas materiał dowodowy organ bezpodstawnie przyjął, że Skarżący nie był w dobrej wierze wobec oszustwa podatkowego, jak również że formułowane wobec Skarżącego zarzuty i oceny są nadmiernie rygorystyczne i oderwane od realiów rynkowych, podczas gdy prawidłowa ocena całokształtu materiału dowodowego, w szczególności brak jakiejkolwiek weryfikacji kontrahentów przez Skarżącego uzasadnia stanowisko organu podatkowego, że Skarżącemu nie przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego wynikającego z zakwestionowanych faktur, co doprowadziło Sąd do błędnego uznania, że Organ drugiej instancji w sposób wadliwy przeprowadził postępowanie i dokonał błędnej oceny zebranego materiału dowodowego;