Uzasadnienie
Naczelny Sąd Administracyjny wyrokiem z 13 czerwca 2025 r. sygn. akt II FSK 1288/22 w sprawie ze skarg kasacyjnych A B oraz Szefa Krajowej Administracji Skarbowej od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego
w Warszawie z 8 czerwca 2022 r. sygn. akt III SA/Wa 2308/21 w sprawie ze skargi A B na decyzję Szefa Krajowej Administracji Skarbowej (dalej zwany: Szef KAS) z 26 lipca 2021 r. nr DKP2.8011.16.2020/18 w przedmiocie podatku dochodowego od osób fizycznych za 2017 r. - oddalił skargi kasacyjne oraz odstąpił od zasądzenia zwrotu koszów postępowania kasacyjnego w całości.
Pismem z 22 sierpnia 2025 r. Szef KAS wniósł o wykładnię uzasadnienia opisanego wyżej wyroku Naczelnego Sądu Administracyjnego w zakresie zaleceń
co do dalszego postępowania. W uzasadnieniu wniosku wskazał, że postępowanie podatkowe, którego dotyczyła ww. decyzja Szefa KAS, wydana została przez ten organ w pierwszej instancji jako wynik postępowania wszczętego z urzędu w oparciu o art. 119g § 1 ustawy z 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2020 poz. 1325 ze zm. – dalej zwana: O.p.), w ramach którego zastosowanie znajdowały przepisy ogólnej klauzuli przeciwko unikaniu opodatkowania (nawet jeśli nie wyłącznie). Tym samym jedynym organem właściwym w sprawach zainicjowanych tego rodzaju wszczęciem jest Szef KAS. A contrario, naczelnik urzędu skarbowego czy celno-skarbowego nie jest organem właściwym w sprawie postępowania podatkowego wszczętego z urzędu w trybie art. 119g § 1 Ordynacji podatkowej i nie może prowadzić postępowania, w którym znajdzie zastosowanie ogólna klauzula przeciwko unikaniu opodatkowania. Stanowisko takie wyraził już Naczelny Sąd Administracyjny w innej sprawie zakończonej wyrokiem z 9 listopada 2023 r. sygn. II FSK 1242/23. Tymczasem w wyroku, którego dotyczy przedmiotowy wniosek, Naczelny Sąd Administracyjny wskazał w wytycznych co do dalszego postępowania, zawartych w uzasadnieniu wyroku, że w celu załatwienia sprawy Szef KAS powinien uchylić decyzję organu I instancji i przekazać sprawę do organu właściwego.
Co istotne, postępowanie przeciwko unikaniu opodatkowania wszczęte zostało przez Szefa KAS i to On jest "organem właściwym". Nie istnieje prawna dopuszczalność przekazania sprawy przez Szefa KAS właściwemu miejscowo dla podatnika naczelnikowi urzędu skarbowego do dalszego prowadzenia w trybie "zwykłym", które to postępowanie zostało z urzędu wszczęte w trybie "kwalifikowanym" (tj. w oparciu