Uzasadnienie
Decyzją z 24 października 2025r. Naczelnik Kujawsko-Pomorskiego Urzędu Celno-Skarbowego w Toruniu określił L. S. ("Skarżący", "Strona", "Podatnik") wysokość zobowiązania podatkowego w podatku dochodowym od osób fizycznych za 2020 r. w kwocie 237.473 zł.
Po rozpatrzeniu odwołania, decyzją z dnia 30 stycznia 2026 r. Dyrektor Izby Administracji Skarbowej w Bydgoszczy utrzymał w mocy decyzję organu pierwszej instancji.
W uzasadnieniu organ podał, że przedmiot sporu w sprawie sprowadza się do odpowiedzi na pytanie, czy słusznie zakwestionowano Podatnikowi prawo do odliczenia w zeznaniu o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty) w roku podatkowym 2020 (PIT-36L), złożonym 13 grudnia 2021r. straty za 2018 r. w wysokości 1.249.860,60 zł, oraz czy okoliczność wniesionej skargi kasacyjnej do Naczelnego Sądu Administracyjnego w sprawie poniesionej przez Podatnika straty z działalności gospodarczej w 2018 r. stanowi o istnieniu zagadnienia wstępnego jako przesłanki obligatoryjnego zawieszenia postępowania. Organ podał, że w 2020r. Skarżący uzyskiwał przychody:
1) z pozarolniczej działalności gospodarczej prowadzonej pn. L. S.. Podatnik prowadzi działalność gospodarczą od 1995 r. Początkowo przeważającym przedmiotem działalności gospodarczej była produkcja konstrukcji metalowych i ich części. W 2020r. przedmiotem działalności była jedynie dzierżawa własności intelektualnej. Zdarzenia gospodarcze ewidencjonowane były w podatkowej księdze przychodów i rozchodów. W 2020r. zaewidencjonowano w podatkowej księdze przychodów i rozchodów:
- przychody w łącznej kwocie 18.377,05 zł z tytułu udzielenia licencji do logo,
- pozostałe koszty w łącznej kwocie 34.304,48 zł z tytułu opłat leasingowych oraz kosztów ubezpieczenia i użytkowania samochodu.
Dochód z prowadzonej działalności gospodarczej z tytułu dzierżawy własności intelektualnej według informacji o wysokości dochodu (straty) z pozarolniczej działalności gospodarczej w roku podatkowym 2020 – PIT/B i według organu nie wystąpił, strata z tego tytułu wyniosła 15.927,43 zł. Prowadzoną przez Skarżącego podatkową księgę przychodów i rozchodów uznano za rzetelną i niewadliwą.
2) z tytułu udziału w spółce niebędącej osobą prawną – [...] Sp. z o.o. z siedzibą w B., a następnie po przekształceniu tego podmiotu – w spółce [...] sp.k., w której przychodach, kosztach i dochodach Skarżący uczestniczył w 33 %.
Z tytułu udziału w spółce [...] Sp. z o.o. sp.k. (do 29 maja 2020 r. [...] Sp. z o.o.), w informacji PIT/B Podatnik wykazał przychody w kwocie 6.092.226,35 zł, koszty uzyskania przychodów w kwocie 4.727.605,88 zł oraz dochód w wysokości 1.364.620,47 zł, obliczone w proporcji do udziałów posiadanych w Spółce (33 %). Księgi rachunkowe (podatkowe) [...] Sp. z o.o. sp.k. uznano za prowadzone rzetelnie i niewadliwie.
3) z tytułu udziału w [...] sp. z o.o. sp. k. z siedzibą w B., w której przychodach, kosztach i dochodach w 2020 r. Podatnik uczestniczył w 33 %.
Z tego tytułu przychody, zadeklarowane w informacji PIT/B, wyniosły 32.732,68 zł, koszty uzyskania przychodów 52.159,65 zł oraz strata w wysokości (-) 19.426,97 zł. Księgi rachunkowe (podatkowe) [...] sp. z o.o. sp. k. uznano za prowadzone rzetelnie i niewadliwie.
W korekcie zeznania o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty) w roku podatkowym 2020 (PIT-36L), Podatnik wykazał łączny przychód z pozarolniczej działalności gospodarczej w kwocie 6.143.336,08 zł, koszty uzyskania przychodów w kwocie 4.814.070,01 zł oraz dochód w wysokości 1.329.266,07 zł, natomiast podatek po odliczeniach 0,02 zł oraz podatek należny w kwocie 0 zł. Organ podał, że na podstawie decyzji z 6 kwietnia 2023 r. (utrzymanej w mocy decyzją z 31 stycznia 2024r.) Szef KAS określił dla Skarżącego wysokość zobowiązania podatkowego w podatku dochodowym od osób fizycznych za 2018 r. w kwocie 153.113 zł, podczas gdy Strona zadeklarowała stratę w kwocie 2.845.811,34 zł. W konsekwencji Naczelnik Kujawsko-Pomorskiego Urzędu Celno-Skarbowego za bezzasadne uznał rozliczenie ww. straty za 2018 r. w zeznaniu rocznym PIT-36L za 2020 r.
W zakresie prawidłowości rozliczeń z budżetem państwa z tytułu podatku dochodowego od osób fizycznych za 2018 r., od dochodów z pozarolniczej działalności gospodarczej, opodatkowanych na zasadach określonych w art. 30c ustawy z dnia 26 lipca 1991 r. o podatku dochodowym od osób fizycznych (Dz. U. z 2026 r., poz. 592 ze zm., dalej: "u.p.d.o.f."), organ wskazał, pismem z 29 stycznia 2021 r. Naczelnik Kujawsko-Pomorskiego Urzędu Celno-Skarbowego w Toruniu wystąpił do Szefa Krajowej Administracji Skarbowej z wnioskiem o przejęcie ww. sprawy. Szef Krajowej Administracji Skarbowej, po przeanalizowaniu wniosku oraz załączonych akt sprawy, stwierdził, że w sprawie może zostać wydana decyzja z zastosowaniem art. 119a ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2025 r., poz. 111 ze zm., dalej: "O.p."). Zgodnie z art. 119g § 1 pkt 1 i 2 oraz art. 119ga § 3 O.p., postanowieniami z 4 czerwca 2021r. przejął w całości ww. kontrolę celnoskarbową i jednocześnie, w myśl art. 119g § 3 O.p., przejmując kontrolę, Szef KAS zawiesił ją z urzędu. Następnie postanowieniem z 4 czerwca 2021r. Szef KAS wszczął z urzędu postępowanie podatkowe wobec Skarżącego w przedmiocie podatku dochodowego od osób fizycznych za 2018 r. wykazanego w złożonym zeznaniu PIT-36L o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty) w roku podatkowym. W wyniku przeprowadzonego postępowania podatkowego Szef Krajowej Administracji Skarbowej stwierdził, że w zakresie rozliczenia w podatku dochodowym od osób fizycznych za 2018r. znajduje zastosowanie art. 119a O.p. Zakwestionowano koszty uzyskania przychodów w wysokości 3.702.724 zł, na które złożyły się:
- niezamortyzowana część 1/3 Wzoru Wspólnotowego w wysokości 3.312.964 zł (wartość początkowa 3.702.724 zł pomniejszona o sumę naliczonych odpisów amortyzacyjnych za miesiące od styczna do października 2018 r. w kwocie 389.760 zł),
- naliczone odpisy amortyzacyjne za okres od styczna do października 2018 r. w kwocie 389.760 zł.
W dniu 6 kwietnia 2023r. Szef KAS wydał decyzję, w której określił wysokość zobowiązania podatkowego w podatku dochodowym od osób fizycznych za 2018 r. w kwocie 153.113 zł, podczas gdy Skarżący zadeklarował stratę w kwocie 2.845.811,34 zł. Od ww. decyzji wniesione zostało odwołanie. Decyzją z 31 stycznia 2024 r. Szef KAS utrzymał w mocy decyzję organu pierwszej instancji. Następnie od ww. decyzji została wniesiona skarga do WSA w Warszawie. W wyroku z 6 czerwca 2024 r., sygn. akt III SA/Wa 813/24 Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie oddalił wniesioną skargę. Przedmiotowa decyzja jest zatem ostateczna w administracyjnym toku instancji.
W rozpoznawanej sprawie organ odwoławczy wskazał, iż ma możliwość rozstrzygnięcia co do prawidłowości rozliczenia Skarżącego z tytułu podatku dochodowego od osób fizycznych za 2020r. Zdaniem Dyrektora Izby Administracji Skarbowej nie istnieje bowiem związek między tymi postępowaniami (sądowym, a podatkowym), co sprawia, że pierwsza z tych spraw nie stanowi zagadnienia wstępnego z punktu widzenia postępowania podatkowego, które może zostać zakończone bez konieczności oczekiwania na rozstrzygnięcie Naczelnego Sądu Administracyjnego w związku z wniesieniem przez Skarżący skargi kasacyjnej od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie z 6 czerwca 2024 r., sygn. akt III SA/Wa 813/24. Istotne w sprawie jest, że w wyroku z 6 czerwca 2024 r. Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie oddalił wniesioną skargę. Decyzja Szefa KAS z 31 stycznia 2024 r., w której zostało określone Skarżącemu zobowiązanie podatkowe w podatku dochodowym odo osób fizycznych za 2018 r. w kwocie 115.113 zł jest ostateczna w administracyjnym toku instancji. Szaf KAS potwierdził tym samym, że za 2018 r. Skarżący nie poniósł straty, lecz osiągnął dochód w wysokości 856.912,66 zł. Wobec tego, organ podatkowy pierwszej instancji nie miał podstaw do uwzględnienia w rozliczeniu podatku za 2020 r. wykazanej przez Skarżącego części straty z 2018 r., tj. straty w wysokości 1.249.860,60 zł. W ocenie Dyrektora Izby Administracji Skarbowej, tocząca się przed Naczelnym Sądem Administracyjnym, w związku z wniesieniem przez Skarżącego skargi kasacyjnej, dotycząca rozliczenia za 2018 r. nie stanowi przesłanki do zawieszenia postępowania, zgodnie z art. 201 § 1 pkt 2 O.p. Rozpoznanie przez Naczelny Sąd Administracyjny sprawy za 2018 r. nie jest zagadnieniem wstępnym, od którego zależy wydanie decyzji w sprawie określenia wysokości zobowiązania podatkowego w podatku dochodowym od osób fizycznych za 2020 r. Każdą z tych spraw należy bowiem traktować jako sprawę odrębną, a ustawodawca w żaden sposób nie uzależnił wyniku jednej z tych spraw od drugiej. Postępowania w sprawie podatku dochodowego od osób fizycznych za 2018 r. oraz za 2020 r. są samodzielnymi postępowaniami dotyczącymi zamkniętych okresów podatkowych. Decyzja określająca Skarżącemu zobowiązanie podatkowe za 2018 r. jest dowodem w sprawie, jednak okoliczności, że rozstrzygnięcie Szefa KAS potwierdzone następnie przez Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie, zostało zaskarżone do Naczelnego Sądu Administracyjnego, nie można utożsamiać z zagadnieniem wstępnym, o którym mowa w art. 201 § 1 pkt 2 O.p.