Uzasadnienie
Pismem z [...] stycznia 2025 r. [...] Spółka cywilna w B. ("Skarżąca", "Strona", "Spółka") złożyła wniosek o wydanie postanowienia w sprawie zaliczenia wpłaty na poczet zaległości podatkowych.
Postanowieniem z [...] sierpnia 2025 r. po ponownym rozpatrzeniu sprawy wskutek uchylenia przez organ odwoławczy postanowienia z dnia [...] marca 2025 r., Naczelnik Trzeciego Urzędu Skarbowego w B. wpłatę z [...] września 2024 r. w kwocie [...]zł zaliczył na poczet zaległości z tytułu podatku od towarów i usług za marzec 2021 r. na należność główną w kwocie [...]zł i odsetki za zwłokę w kwocie [...]zł.
Rozpatrując wniesione zażalenie Dyrektor Izby Administracji Skarbowej postanowieniem z dnia [...] listopada 2025 r. utrzymał w mocy postanowienie organu pierwszej instancji. W uzasadnieniu rozstrzygnięcia organ podał, że przed dokonaniem zaliczenia nadpłaty pracownicy urzędu skarbowego prowadzili ze Skarżącą korespondencję, w której wskazywali na błędną interpretację przepisów. Spółka poinformowała, że powodem złożenia [...] marca 2021 r. korekt deklaracji VAT za okres od stycznia 2021 r. do stycznia 2022 r. były zmiany w rejestrach podatku należnego VAT na skutek aneksów do umów leasingu operacyjnego sporządzonych na okoliczność błędnego zakwalifikowania pierwotnych umów jako leasing operacyjny zamiast leasing finansowy. Spółka błędnie zakwalifikowała umowy stanowiące podstawową działalność Spółki co spowodowało konieczność złożenia korekt. Ponadto w pierwotnej wersji deklaracji za grudzień 2021 r. nie ujęto sprzedaży środka trwałego. Organ podatkowy skierował do Spółki wezwanie o przywrócenie pierwotnych plików JPK od stycznia 2021 r. wskazując, że dokonywana czynności nie spełniają definicji leasingu finansowego i Strona nie ma prawa do zastosowania procedury VAT marża do wystawiania faktur w zakresie towarów i usług, nie posiada uprawnień do udzielania kredytów i pożyczek stanowiących usługę zwolnioną. W odpowiedzi Spółka wyjaśniła, że przedłożyła wszystkie dokumenty, o które prosił organ podatkowy oraz wysyłała pliki i wyjaśnienia do każdego wezwania i maila, które do Spółki wpłynęło. W trakcie prowadzonych czynności sprawdzających Spółka poinformowała, że w ramach działalności gospodarczej zawierane były z klientami umowy kupna-sprzedaży wraz z leasingiem operacyjnym. Na podstawie ogólnodostępnych interpretacji dokonano zmiany sposobu rozliczenia podatku VAT na leasing finansowy i dokonano korekt deklaracji.
Organ pierwszej instancji uznał rozliczenia w zakresie podatku od towarów i usług za błędne. Z uwagi na brak interpretacji indywidualnej oraz brak jednoznacznego stanowiska w zakresie sposobu rozliczenia umów, organ podatkowy wszczął kontrolę podatkową, która została zakończona protokołem kontroli i złożeniem przez Spółkę korekt deklaracji VAT-7 za miesiące od stycznia do sierpnia 2021 r. Ostatecznie po złożonych korektach powstało zobowiązanie w podatku od towarów i usług za marzec 2021 r. na łączną kwotę [...]zł, z czego kwota [...]zł to zobowiązanie wynikające z rozliczenia nadpłaty na zaległości podatkowe, którego termin płatności nie został jeszcze określony, a kwota [...]zł to zaległość z ustawowym terminem płatności na [...] kwietnia 2021 r.
Organ wyjaśnił, że postanowienie będące przedmiotem tego postępowania obejmuje zaliczenie wpłaty z [...] września 2024 r. w wysokości [...] zł na zaległość podatkową za marzec 2021 r. z określonym terminem płatności na [...] kwietnia 2021 r. Odsetki za zwłokę z tytułu podatku od towarów i usług za marzec 2021 r. zostały naliczone od zaległości w kwocie [...]zł od następnego dnia po dniu, w którym upłynął termin płatności, tj. od [...] kwietnia 2021 r. do dnia dokonania wpłaty, tj. do [...] września 2024 r. Początkiem okresu naliczania odsetek za zwłokę jest, zgodnie z art. 53 § 4 ustawy Ordynacja podatkowa, dzień następujący po dniu upływu terminu płatności podatku. Kwota wpłaty nie pokrywała kwoty zaległości podatkowej wraz z odsetkami za zwłokę, dlatego wpłatę tę zaliczono proporcjonalnie na poczet kwoty zaległości podatkowej oraz kwoty odsetek za zwłokę.
Zdaniem organu odwoławczego przedstawiony stan faktyczny sprawy świadczy o tym, że organ pierwszej instancji dokonując zaliczenia wpłaty nie naruszył przepisów prawa. Spółka była świadoma prowadzonych czynności sprawdzających, wiedziała o wątpliwościach organu podatkowego, co do sposobu naliczenia przez Spółkę podatku od towarów i usług za 2021 rok i prawidłowej interpretacji przepisów. Pomimo prośby o wycofanie korekt do czasu uzyskania interpretacji indywidualnej, nie zdecydowała się na ich wycofanie. Fakt wszczęcia w tym zakresie kontroli podatkowej, także świadczy o tym, że złożone korekty budziły wątpliwości. Postanowienia w zakresie zaliczenia nadpłat na zaległości podatkowe nie są potwierdzeniem prawidłowości dokonanych rozliczeń podatku od towarów i usług, nie można traktować ich jako interpretacji przepisów. Skarżąca nie dysponuje interpretacją indywidulaną, a interpretacje wydane dla innych podmiotów są wiążące wyłącznie dla ich wnioskodawców i nie mogą być swobodnie przyjmowane w innych sprawach.
W złożonej skardze Spółka wniosła o uchylenie zaskarżonego postanowienia i umorzenie sprawy zarzucając naruszenie:
1) art. 121 § 1 i art. 14k § 1 i § 3, art. 14m § 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2025 r. poz. 111; dalej: "O.p.") w zw. z art. 72 § 1 pkt 1, § 4 w zw. z art. 52 § 1 pkt 2, art. 53 § 1 oraz art. 56b pkt 1 O.p. przez błędną wykładnię i niewłaściwe zastosowanie, polegającą na przyjęciu, że istnieją podstawy do naliczenia odsetek od zaległości podatkowej, w sprawie w której powstanie zaległości podatkowej było spowodowane działaniem organu podatkowego, który poprzez stwierdzenie i zwrócenie nadpłaty podatku od towarów i usług utwierdził podatnika co do prawidłowości sposobu rozliczenia podatku od towarów i usług, następnie zakwestionowanego w toku kontroli podatkowej;
2) art. 62 § 1 O.p. przez nieprawidłowe zarachowanie dokonanych wpłat na poczet odsetek od zaległości podatkowych za okres od dnia zwrotu (zaliczenia) nadpłaty podatku do dnia doręczenia protokołu kontroli podatkowej, w którym zakwestionowano prawidłowość rozliczenia podatku w sposób uprzednio przyjęty za prawidłowy w toku postępowania w sprawie stwierdzenia nadpłaty podatku.
W odpowiedzi na skargę organ wniósł o jej oddalenie.
Wojewódzki Sąd Administracyjny, zważył co następuje:
Zgodnie z art. 1 § 1 i § 2 ustawy z dnia 25 lipca 2002 r. – Prawo o ustroju sądów administracyjnych (tekst jedn. Dz.U. z 2024 r., poz. 1267), sądy administracyjne kontrolują prawidłowość zaskarżonych aktów administracyjnych, między innymi postanowień ostatecznych, przy uwzględnieniu kryterium ich zgodności z prawem. Postanowienie podlega uchyleniu, jeśli sąd stwierdzi naruszenie prawa materialnego w stopniu mającym wpływ na wynik sprawy, naruszenie prawa będące podstawą wznowienia postępowania lub inne naruszenie prawa mogące mieć istotny wpływ na wynik sprawy (art. 145 § 1 pkt 1 lit. a-c ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. – Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (tekst jedn. Dz.U. z 2026 r., poz. 143 dalej: "p.p.s.a.") lub też naruszenie prawa będące podstawą stwierdzenia nieważności postanowienia (art. 145 § 1 pkt 2 p.p.s.a.).