Uzasadnienie
1. Przedmiotem zaskarżenia w niniejszej sprawie jest decyzja Dyrektora Izby Administracji Skarbowej z dnia 25 czerwca 2025 r., nr [...], utrzymująca w mocy decyzję Naczelnika Pierwszego [...] Urzędu Skarbowego w W. z dnia 28 marca 2025 r., nr [...], w przedmiocie odmowy S. S.A. z siedzibą w P. (dalej jako: "strona", "bank", "spółka" lub "skarżąca"), stwierdzenia nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych w kwocie 959 385 zł, pobranego przez płatnika z tytułu zmiany umowy spółki, uchwałą z dnia 5 maja 2022 r., w związku z podwyższeniem kapitału zakładowego.
1.1. Z akt sprawy wynika, że Nadzwyczajne Walne Zgromadzenie Akcjonariuszy spółki w dniu 5 maja 2022 r. podjęło, m. in. uchwałę, nr [...], w sprawie podwyższenia kapitału zakładowego banku w drodze emisji akcji imiennych, zwykłych serii "[...]" i zaoferowania ich w drodze prywatnej subskrypcji, pozbawienia prawa poboru dotychczasowych akcjonariuszy, o kwotę od 100 zł do 250 000 000 zł, tj. do kwoty nie wyższej niż 671 383 100 zł, poprzez emisję od 1 do 2 500 000 sztuk akcji zwykłych, o wartości nominalnej 100 zł każda. Akcje miały zostać objęte wyłącznie w zamian za wkłady pieniężne, wniesione przez inwestorów kwalifikowanych, wybranych przez zarząd spółki w terminie przez niego określonym. Emisja akcji miała nastąpić w drodze subskrypcji prywatnej z wyłączeniem prawa poboru dotychczasowych akcjonariuszy. Od czynności udokumentowanej powyższą uchwałą notariusz, jako płatnik podatku od czynności cywilnoprawnych, pobrał od spółki ten podatek w kwocie 1 250 000 zł, tj. w stawce 0,5% od podstawy opodatkowania w kwocie 250 000 000 zł.
Wniosek banku z dnia 20 stycznia 2025 r. o zwrot podatku od czynności cywilnoprawnych został uwzględniony przez Naczelnika Pierwszego [...] Urzędu Skarbowego w W., decyzją z dnia 21 marca 2025 r., ale tylko do wysokości 290 615 zł, w związku z wykazaniem w KRS, że w wyniku zmiany umowy spółki w drodze podwyższenia kapitału zakładowego spółki uchwalonego w dniu 5 maja 2022 r., zarejestrowano wysokość niższą niż uchwalona, tj. 613 260 100 zł.
1.2. Z kolei decyzją z dnia 28 marca 2025 r., nr [...], organ I instancji odmówił stwierdzenia nadpłaty pozostałej części podatku od czynności cywilnoprawnych, pobranego przez notariusza w dniu 5 maja 2022 r., tj. kwoty 959 385 zł. W motywach powyższego rozstrzygnięcia opisano stanowisko spółki, z którego wynika, że na dzień 5 maja 2022 r. banki spółdzielcze jako banki i jako spółdzielnie spełniały przesłanki z definicji jednostki gospodarki uspołecznionej, a tym samym obejmowanie przez nie akcji w ramach podwyższenia kapitału zakładowego spółki powinno być wyłączone z opodatkowania podatkiem od czynności cywilnoprawnych. Powołując się na zasadę nadrzędności prawa wspólnotowego nad ustawodawstwem krajowym i zasadę bezpośredniej skuteczności dyrektyw unijnych oraz klauzulę stand-still, spółka wskazała na art. 7 ust. 1 i 2 Dyrektywy Rady 2008/7/WE z dnia 12 lutego 2008 r. dotyczącej podatków pośrednich od gromadzenia kapitału w związku z art. 7 ust. 1 i 2 Dyrektywy Rady 69/335/EWG z dnia 17 lipca 1969 r. dotyczącej podatków pośrednich od gromadzenia kapitału i przyjęła, że brak jest opodatkowania wkładów do spółek kapitałowych wnoszonych przez jednostki gospodarstwa uspołecznionego (dalej jako: "j.g.u.") na dzień 1 lipca 1984 r. Zdaniem banku, wszelkie czynności, które 1 lipca 1984 r. były w kraju zwolnione z podatku kapitałowego, podlegają obowiązkowemu zwolnieniu. Na potwierdzenie powyższego stanowiska spółka przywołała orzecznictwo Trybunału Sprawiedliwości Unii Europejskiej (wyrok z dnia 21 czerwca 2007 r., w sprawie C-366/05, Optimus i z dnia 16 lutego 2012 r., w sprawie C-372/10, Pak-Holdco) oraz wyrok Naczelnego Sądu Administracyjnego z dnia 16 listopada 2011 r., o sygn. akt II FSK 895/11 (treść powołanych wyroków sądów administracyjnych dostępna jest w Centralnej Bazie Orzeczeń Sądów Administracyjnych, pod adresem: bazy CBOSA). Spółka podniosła również, że spółdzielnie oszczędnościowo-pożyczkowe zostały zobligowane do używania ujednoliconej nazwy ze słowami "bank spółdzielczy", stając się jednocześnie bankami w pełnym tego słowa znaczeniu na podstawie ustawy o prawie bankowym z 1975 r. Na potwierdzenie swojego stanowiska spółka przywołała również wyroki NSA z dnia 26 czerwca 2024 r., o sygn. akt III FSK 31/24 oraz 14 listopada 2024 r., o sygn. akt III FSK 680/24.
Odnosząc się do powyższej argumentacji organ I instancji stwierdził, że wniesienie wkładu pieniężnego na pokrycie podwyższenia kapitału zakładowego spółki kapitałowej, podlega co do zasady opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych. Przyjęto, że uregulowane w art. 9 pkt 11 lit. d) ustawy z dnia 9 września 2000 r. o podatku od czynności cywilnoprawnych (Dz. U. z 2020 r., poz. 815 ze zm. – dalej w skrócie: "u.p.c.c.") zwolnienie podmiotowo-przedmiotowe, nie obejmuje swoim zakresem wniesienia przez banki spółdzielcze wkładów pieniężnych na pokrycie podwyższenia kapitału zakładowego strony. Wyjaśniono, że aktem prawnym harmonizującym podatki kapitałowe w Unii Europejskiej była Dyrektywa Rady 69/335/EWG z dnia 17 lipca 1969 r. dotycząca podatków pośrednich od gromadzenia kapitału (Dz. Urz. WE L 249 z 3 października 1969 r. ze zm. – dalej: "Dyrektywa 69/335/EWG"), która została zmieniona Dyrektywą Rady 85/303/EWG z dnia 10 czerwca 1985 r. Następnie, z dniem 1 stycznia 2009 r. została zastąpiona Dyrektywą Rady 2008/7/WE z dnia 12 lutego 2008 r. dotyczącą podatków pośrednich od gromadzenia kapitału (Dz. Urz. UE L 46 z 21 lutego 2008 r. ze zm.). Co do zasady, prawodawca europejski wprowadził zasadę opodatkowania podatkiem kapitałowym wszelkich czynności prawnych, dotyczących utworzenia lub zmiany umowy spółki. Jednakże przepis art. 7 ust. 1 akapit pierwszy Dyrektywy Rady 69/335/EWG stanowił, że Państwa Członkowskie zwolnią z podatku kapitałowego operacje inne niż operacje określone w art. 9, które w dniu 1 lipca 1984 r. były zwolnione z podatku lub opodatkowane stawką 0,50% lub niższą.
W świetle powyższego organ I instancji wyjaśnił, że w przypadku państwa takiego jak RP, które przystąpiło do UE ze skutkiem od 1 maja 2004 r., wobec braku postanowień wprowadzających odstępstwa w akcie przystąpienia państwa do UE, przepis art. 7 ust. 1 Dyrektywy 69/335/EWG powinien być interpretowany w ten sposób, że przewidziane w niej obowiązkowe zwolnienie dotyczy wyłącznie czynności objętych zakresem zastosowania tej dyrektywy, ze zmianami, które to czynności w dniu 1 lipca 1984 r. były w owym państwie zwolnione od podatku kapitałowego lub były opodatkowane tym podatkiem wg stawki obniżonej wynoszącej 0,5% lub niższej. Zdaniem organu I instancji, opodatkowanie czynności podwyższenia kapitału zakładowego podatkiem od czynności cywilnoprawnych przez kraj jest dopuszczalne, o ile podatek ten był nakładany w dniu 1 stycznia 2006 r. W krajowym stanie prawnym na dzień 1 lipca 1984 r. kwestia opodatkowania operacji na kapitale spółek była uregulowana ustawą z dnia 19 grudnia 1975 r. o opłacie skarbowej (Dz. U. z 1975 r. Nr 45, poz. 226), która w art. 1 ust. 1 pkt 3 lit. d) przewidywała pobieranie opłaty skarbowej od pism stwierdzających zawiązanie spółki przez osoby fizyczne i osoby prawne niebędące jednostkami gospodarki uspołecznionej. Zgodnie z art. 1 ust. 1 pkt 2 lit. e) w zw. z ust. 2 ustawy z dnia 31 stycznia 1989 r. o opłacie skarbowej (Dz. U. z 1989 r., Nr 4, poz. 23 ze zm.), która zastąpiła wcześniejszą ustawę z 1975 r. - opłacie skarbowej podlegały umowy spółek i ich zmiany, jeżeli powodowały podwyższenie podstawy obliczenia tej opłaty, a podstawę obliczenia opłaty przy powiększeniu kapitału zakładowego stanowiła wartość wkładów (udziałów, akcji) powiększających kapitał zakładowy (art. 10 ust. 1 pkt 11 lit. b) tej ustawy). Podsumowując organ I instancji uznał, że w stanie prawnym obowiązującym zarówno 1 lipca 1984 r., jak i 1 stycznia 2006 r., podwyższenie kapitału zakładowego spółki było objęte podatkiem od wkładów kapitałowych, w rozumieniu art. 7 ust. 1 Dyrektywy 69/335/EWG, a później Dyrektywy 2008/7/WE, w stawce wyższej niż 0,5%. W ocenie organu I instancji nie ma w tym zakresie sprzeczności krajowej u.p.c.c. z prawem wspólnotowym.
Odnosząc się do wywodów spółki, że przesłanką zwolnienia z opodatkowania z art. 1 ust. 1 pkt 3 lit. d) ustawy o opłacie skarbowej z 1975 r., jest okoliczność, że banki spółdzielcze mogłyby na dzień 1 lipca 1984 r. być uznane za jednostkę gospodarki uspołecznionej, a tym samym byłyby zwolnione od opłaty skarbowej, organ I instancji zauważył w pierwszej kolejności, że dyrektywy kapitałowe, na które powołuje się bank, obejmują swoim zakresem jedynie spółki kapitałowe. Skoro tak, to nie może być uznana za zasadną argumentacja, w której spółka, domagająca się zastosowania tego przepisu do swojej sytuacji, odwołuje się do statusu podmiotów wnoszących do niej wkłady pieniężne, jako jednostek gospodarki uspołecznionej. Zgodnie z art. 4 ust. 1 lit. c) Dyrektywy 69/335/EWG, podatkowi kapitałowemu podlega podwyższenie kapitału spółki kapitałowej poprzez wniesienie wkładów jakiegokolwiek rodzaju, a zatem czynność ta należy do operacji objętych zakresem dyrektywy. Wskazana przesłanka ma charakter przedmiotowy, a nie podmiotowy. Reasumując organ I instancji stwierdził, że zmiany w u.p.c.c. w żadnym momencie nie prowadziły do zniesienia przez nasz kraj podatku od czynności cywilnoprawnych od umowy spółki kapitałowej i jej zmiany. Takie czynności były nieprzerwanie opodatkowane opłatą skarbową, a następnie podatkiem od czynności cywilnoprawnych. Tym samym nie zrezygnowano z opodatkowania czynności wniesienia wkładów, tj. opodatkowania operacji, o których mowa w art. 3 lit. a) – c) Dyrektywy 2008/7/WE. W ocenie organu I instancji opodatkowanie podatkiem od czynności cywilnoprawnych - czynności zmiany umowy spółki kapitałowej, związanej z wniesieniem wkładów przez banki spółdzielcze nie narusza zasady stand-still. Za nieistotną organ uznał podniesioną przez spółkę we wniosku o stwierdzenie nadpłaty hipotetyczną konstrukcję podmiotową banków spółdzielczych, tj. spełnianie przesłanek z definicji jednostki gospodarki uspołecznionej, które to jednostki nie występują w obecnym systemie prawnym i za kluczową dla oceny możliwości zastosowania art. 7 ust. 1 Dyrektywy 69/335/EWG uznano kwestię dokonanej operacji, od której został w sprawie naliczony podatek od czynności cywilnoprawnych. W ocenie organu I instancji, w oparciu o współczesne przepisy u.p.c.c., operacja podwyższenia kapitału zakładowego spółki kapitałowej podlega opodatkowaniu i tego typu operacja byłaby także opodatkowana 1 lipca 1984 r. na gruncie ustawy o opłacie skarbowej, przy uwzględnieniu jej zakresu przedmiotowego.
1.3. W odwołaniu od powyższej decyzji strona, wnosząc o jej uchylenie w całości, zarzuciła naruszenie art. 120 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2025 r., poz. 111 ze zm. – dalej skrócie: "o.p.") oraz art. 7 ust. 1-2 i ust. 5, art. 1 lit. a), art. 2 ust. 1 lit. a), art. 3 lit. c), art. 13 lit. a) i b), art. 15 Dyrektywy 2008/7 w związku z art. 7 ust. 1 i 2 oraz art. 3 ust. 1, art. 4 ust. 1 lit. c), ust. 2, art. 8 Dyrektywy 69/335/EWG oraz art. 1 ust. 1 pkt 1 lit. k), art. 1 ust. 1 pkt 2, art. 1 ust. 2 pkt 1, art. 1 ust. 3 pkt 1 i 2, art. 1a pkt 1 i 2, art. 4 pkt 9, art. 7 ust. 1 pkt 9 u.p.c.c. oraz art. 1 ust. 1 pkt 3 lit. d) ustawy z dnia 19 grudnia 1975 r. o opłacie skarbowej w zw. z § 54 ust. 1, ust. 3 i ust. 4 rozporządzenia Rady Ministrów z dnia 16 maja 1983 r. w sprawie opłaty skarbowej (Dz. U. 1983 r., Nr 34, poz. 161 ze zm. - dalej w skrócie: "rozporządzenie RM") oraz art. 1 ust. 1 pkt 6, 9 w związku z ust. 2 ustawy z dnia 26 lutego 1982 r. o opodatkowaniu jednostek gospodarki uspołecznionej (Dz. U. z 1987 r., Nr 12, poz. 77).
1.4. Dyrektor Izby Administracji Skarbowej, opisaną na wstępie decyzją z dnia 25 czerwca 2025 r., utrzymał w mocy decyzję organu I instancji. W motywach rozstrzygnięcia organ odwoławczy zaznaczył, że kluczowego znaczenia dla rozstrzygnięcia sprawy nabiera to czy państwo polskie, z uwagi na brzmienie przepisów Dyrektywy 69/335/EWG, było po przystąpieniu do Unii Europejskiej uprawnione do dalszego stosowania opodatkowania podatkiem kapitałowym czynności umowy spółki i jej zmiany. Zdaniem organu II instancji, z unormowań dyrektywy kapitałowej wynika, że niezależnie od zwolnienia jakie przewidziane zostało w art. 7 ust. 1 Dyrektywy 69/335/EWG, podatkowi kapitałowemu podlegały określone w art. 4 ust. 1 operacje kapitałowe, w tym zmiana umowy spółki, polegająca na podwyższeniu jej kapitału zakładowego. Jednocześnie prawo do utrzymania opodatkowania tym podatkiem zostało uwarunkowane tym, że 1 lipca 1984 r. według prawa krajowego państwa członkowskiego, operacja kapitałowa nie była zwolniona z podatku kapitałowego lub była opodatkowana stawką podatku wyższą niż 0,5%. Zwolnienie jakie przewidziane zostało w art. 7 ust. 1 Dyrektywy 69/335/EWG nie wyklucza zatem możliwości dalszego stosowania opodatkowania operacji kapitałowych pomimo tego, że nadrzędnym celem Dyrektywy 69/335/EWG jest odstąpienie od stosowania przez państwa członkowskie podatków pośrednich. Zdaniem organu odwoławczego, treść art. 7 ust. 1 Dyrektywy 69/335/EWG wskazuje, że przepis ten powinien być interpretowany w ten sposób, że przewidziane w nim obowiązkowe zwolnienie dotyczy wyłącznie czynności objętych zakresem zastosowania tej dyrektywy, które to czynności 1 lipca 1984 r. były w kraju zwolnione od podatku kapitałowego lub które były opodatkowane owym podatkiem według stawki obniżonej wynoszącej 0,5% lub niższej. Organ odwoławczy stanął na stanowisku, że na dzień 1 lipca 1984 r. umowa spółki, polegająca na utworzeniu spółki podlegała opłacie skarbowej o stawce wyższej niż 0,5%, stosownie do treści przepisów art. 1 ust. 1 pkt 3 lit. d) ustawy z dnia 19 grudnia 1975 r. o opłacie skarbowej. Ustawa o opłacie skarbowej nie definiowała użytego w art. 1 ust. 1 pkt 3 lit. d) terminu "pismo stwierdzające zawiązanie spółki" i nie zawierała także katalogu spółek, których zawiązanie rodziło obowiązek podatkowy. Z powyższego organ II instancji wywiódł, że ustawa nakazywała pobranie podatku od pisma stwierdzającego zawiązanie każdego rodzaju spółki, jaką w czasie obowiązywania ustawy o opłacie skarbowej można było skutecznie zawiązać według prawa krajowego. Uznano, że czynność zawiązania spółki, jak również jej zmiana, polegająca na podwyższeniu kapitału zakładowego, na 1 lipca 1984 r. nie były w polskim porządku krajowym zwolnione z podatku kapitałowego (opłaty skarbowej). W związku z tym państwo nasze, po dniu przystąpienia do Unii Europejskiej, tj. po 1 maja 2004 r., było uprawnione do utrzymania opodatkowania wskazanej czynności podatkiem od czynności cywilnoprawnych. Przewidziana w art. 7 ust. 1 pkt 9 u.p.c.c. stawka podatku od czynności cywilnoprawnych w wysokości 0,5% nie przekracza stawki podatkowej (tj. 1 %) przewidzianej w art. 7 ust. 2 Dyrektywy 69/335/EWG. Podsumowując organ II instancji stanął na stanowisku, że zwolnienie przewidziane w art. 7 ust. 1 Dyrektywy 69/335/EWG nie miało zastosowania do podwyższenia kapitału zakładowego spółki kapitałowej, gdyż na dzień 1 lipca 1984 r. zawarcie umowy spółki oraz podwyższenie kapitału zakładowego, nie podlegały zwolnieniu z opodatkowania podatkiem kapitałowym (w ówczesnym stanie była to opłata skarbowa), a stawka tej opłaty była wyższa od 0,5%.