Uzasadnienie
Przedmiotem skargi X. sp. z o.o. (dalej: spółka, skarżąca, podatnik) jest decyzja Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Rzeszowie z dnia 15 września 2025 r. nr 1801-10V2.4103.1.2025 utrzymującą w mocy decyzję Naczelnika Podkarpackiego Urzędu Celno-Skarbowego w [...] z dnia 29 listopada 2024 r. nr 408000- CKK3.11.5001.63.2024.102, w przedmiocie rozliczenia podatku od towarów i usług za grudzień 2022 r. oraz styczeń i luty 2023 r. oraz ustalenia dodatkowego zobowiązania w podatku od towarów i usług za te okresy.
Jak wynika z akt sprawy i uzasadnienia zaskarżonej decyzji w wyniku przeprowadzonej kontroli celno-skarbowej stwierdzono nieprawidłowości w rozliczeniu skarżącej podatku od towarów i usług za okresy rozliczeniowe od grudnia 2022 r. do lutego 2023 r., które przedstawiono w wyniku kontroli z dnia 13 maja 2024 r.
Postanowieniem z dnia 26 lipca 2024 r. poinformowano spółkę o przekształceniu kontroli celno-skarbowej w postępowanie podatkowe w zakresie prawidłowości i rzetelności rozliczenia podatku VAT za poszczególne okresy rozliczeniowe od grudnia 2022 r. do lutego 2023 r.
W toku kontroli, a następnie postępowania ustalono, że X. sp. z o.o. w ewidencji JPK_VAT7M za okres od grudnia 2022 do lutego 2023 r., dokonała korekty wysokości podstawy opodatkowania oraz podatku należnego, zgodnie z regulacją art. 89a ust. 1 ustawy VAT, tj. w ramach tzw. ulgi za złe długi z tytułu faktur wystawionych na rzecz E. sp. z o.o. Organ wskazał na błędne rozliczenie faktur:
1. nr [...] z dnia 14 września 2022 r., wartość netto – [...] zł, VAT - 74.175 zł, termin płatności 28 września 2022 r.,
2. nr [...] z dnia 21 września 2022 r., wartość netto – [...] zł, VAT - 139.725 zł, termin płatności 5 października 2022 r.,
3. nr [...] z dnia 28 października 2022 r., wartość netto – [...] zł, VAT - 28.175 zł, termin płatności 11 listopada 2022 r.,
4. nr [...] z dnia 28 października 2022 r., wartość netto – [...] zł, VAT - 100.050,00 zł, termin płatności 11 listopada 2022 r.
Korekty podstawy opodatkowania oraz podatku należnego dokonano w związku nieuregulowaniem przez firmę E. sp. z o.o. wierzytelności z ww. faktur w terminie 90 dni od dnia upływu terminów ich płatności. W toku postępowania organ ustalił, że na podstawie umowy podwykonawczej nr [...] z dnia 1 września 2021 r. zawartej pomiędzy X. sp. z o.o., a E. sp. z o.o. (zmienionej aneksem nr 1 z dnia 26 października 2021 r. oraz aneksem nr 2 z dnia 9 czerwca 2022 r.), a także na podstawie porozumienia z dnia 27 czerwca 2022 r. E. sp. z o.o. obciążyła kontrolowaną spółkę karami umownymi, kosztami ogólnymi budowy oraz kosztami wykonania zastępczego w oparciu o noty księgowe z dnia 21 października 2022 r. nr [...], nr [...], nr [...], nr [...], nr [...], [...], [...], [...]. Kary te zostały potrącone przez firmę E. sp. z o.o. z należności za roboty o czym X. sp. z o.o. miała zostać powiadomiona. Naczelnik UCS w [...] uznał więc, że skoro spółkom X. i E. przysługiwały względem siebie wzajemne wierzytelności pieniężne, to E. sp. z o.o. mogła uregulować swój dług wobec X. sp. z o.o. (należność za wykonanie umowy podwykonawczej nr [...]) korzystając z przysługującego jej prawa potrącenia. Tym samym, w ocenie organu kontroli celno-skarbowej X. sp. z o.o. nie miała prawa do dokonania korekty z tytułu ulgi za złe długi, z tytułu faktur:
- nr [...] - w części, tj. – [...] zł netto, VAT - 39.675 zł,
- nr [...], [...], nr [...] - w całości.
W związku z powyższym stwierdzono, że prowadzone przez spółkę rejestry sprzedaży dla celów rozliczenia podatku VAT za okres od grudnia 2022 r. do lutego 2023 r. są nierzetelne w części ujęcia w nich korekty wysokości podstawy opodatkowania oraz podatku należnego w ramach "ulgi na złe długi" a dotyczących wymienionych faktur wystawionych przez X. sp. z o.o. na rzecz E. sp. z o.o.
Wobec dokonanych ustaleń, decyzją z dnia 29 listopada 2024 r. Naczelnik Podkarpackiego Urzędu Celno-Skarbowego:
1. określił spółce w podatku VAT za:
- grudzień 2022 r. - nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym do przeniesienia na następny okres rozliczeniowy w wysokości [...] zł oraz nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym do zwrotu na rachunek wskazany przez podatnika w wysokości 74.175 zł,
- styczeń 2023 r. nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym do przeniesienia na następny okres rozliczeniowy w wysokości 0 zł oraz nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym do zwrotu na rachunek wskazany przez podatnika w wysokości [...] zł,
- za luty 2023 r. nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym do przeniesienia na następny okres rozliczeniowy w wysokości 0 zł, nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym do zwrotu na rachunek wskazany przez podatnika w wysokości 0 zł oraz zobowiązanie podatkowe w wysokości [...]zł
2. ustalił spółce dodatkowe zobowiązanie w podatku VAT za:
- grudzień 2022 r. w wysokości [...]zł,
- styczeń 2023 r. w wysokości [...]zł,
- luty 2023 r. w wysokości [...]zł.
W wyniku rozpoznania wniesionego przez spółkę odwołania powyższa decyzja została utrzymana w mocy wskazaną na wstępie decyzją Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Rzeszowie z dnia 15 września 2025 r. W uzasadnieniu swojego rozstrzygnięcia organ odwoławczy w całości podtrzymał ustalenia oraz wyciągnięte na ich podstawie wnioski co do zasadności dokonanego rozliczenia dokonanego przez organ I instancji.
W skardze na decyzję Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Rzeszowie z dnia 15 września 2025 r. spółka zarzuciła naruszenie:
- art. 122, art. 180 § 1, art. 187 § 1 oraz art. 191 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2025 r., poz. 111 ze zm. dalej jako: Ordynacja podatkowa), poprzez nieprawidłowe ustalenie stanu faktycznego sprawy objętej postępowaniem kontrolnym,
- art. 89a ust. 1 ustawy VAT w związku z art. 498 Kodeksu cywilnego, poprzez ich nieprawidłowe zastosowanie do oceny prawnej zgromadzonego materiału dowodowego,
- art. 112b ust. 1 pkt 1 lit. b, c i d, art. 112b ust. 2b ustawy VAT, poprzez ich nieprawidłowe zastosowanie do oceny prawnej zgromadzonego materiału dowodowego,
- art. 193 § 2 i 6 Ordynacji podatkowej poprzez uznanie ksiąg prowadzonych przez podatnika za nierzetelne,
- art. 2a Ordynacji podatkowej w związku z art. 2 Konstytucji RP (w kontekście interpretacji ogólnej Ministra Finansów z 29 grudnia 2015 r. nr PK4.8022.44.2015) oraz w zw. z art. 10 ust. 2 ustawy z dnia 6 marca 2018 r. Prawo przedsiębiorców poprzez brak uwzględnienia przy ocenie materiału dowodowego zasady rozstrzygania wątpliwości na korzyść podatnika (in dubio pro tributario).
W oparciu o powyższe zarzuty spółka wniosła o uchylenie zaskarżonej decyzji w całości oraz poprzedzającej ją decyzji organu I instancji oraz zasądzenie kosztów postępowania sądowego zgodnie z właściwymi przepisami.
W uzasadnieniu skargi spółka wskazała, że w kontekście przytoczonych reguł postępowania, tj. art. 122, art. 180 § 1, art. 187 § 1 oraz art. 191 Ordynacji podatkowej zarzuty co do nieprawidłowego ustalenia stanu faktycznego sprawy oraz oceny materiału dowodowego należy odnieść do stwierdzenia przez organ, że w przedmiotowej sprawie doszło do skutecznego uregulowania przez E. sp. z o.o. należności z tytułu usług i dostaw zrealizowanych przez X. sp. z o.o. na podstawie umowy podwykonawczej nr [...] z dnia 1 września 2021 r., poprzez potrącenie wierzytelności z tytułu kar umownych, kosztów ogólnych budowy oraz kosztów wykonania zastępczego w oparciu o wystawione noty księgowe. Według skarżącej ustalenia organów oraz ich ocena prawna prowadzą do naruszenia ww. przepisów prawa materialnego.
Zdaniem skarżącej, w stanie faktycznym sprawy, została spełniona przesłanka dokonania korekty w postaci upływu terminu 90 dni, określonego w art. 89a ust. 1a ustawy VAT. Skarżąca wskazała, że przedmiotem sporu jest kwestia braku uregulowania należności na rzecz X. sp. z o.o. W jej ocenie przesłanką dokonania potrącenia jest nie tylko istnienie wierzytelności, ale też to, aby była ona wymagalna, a w stanie faktycznym sprawy skarżąca konsekwentnie stoi na stanowisku zgodnie z którym wierzytelności z tytułu nałożenia kar umownych na łączną kwotę [...] zł, są pozbawione podstaw faktycznych, a tym samym trudno uznać, aby istniały i były wymagalne. W ocenie skarżącej E. sp. z o.o. bezpodstawnie naliczyła kary umowne. Wszelkie opóźnienia w realizacji umowy leżały po stronie "zamawiającego", a żądania, "zamawiającego" miały na celu doprowadzenie do uniknięcia zapłaty wynagrodzenia należnego za prawidłowe wykonanie umowy. Według skarżącej roszczenia "zamawiającego" są nieakceptowalne i nie mają podstaw faktycznych oraz prawnych, dlatego należy uznać, że w związku z brakiem istnienia wymagalnej wierzytelności, oświadczenie o potrąceniu było bezskuteczne i nie może prowadzić do wygaszenia zobowiązania E. sp. z o.o. wobec X. sp. z o.o. Nie doszło zatem do uregulowania należności, w konsekwencji czego zostały spełnione przesłanki do dokonania korekty wartości sprzedaży oraz podatku należnego w ramach regulacji art. 89a ust. 1 oraz 1a ustawy VAT.