Uzasadnienie
Zaskarżoną decyzją z dnia 28 listopada 2025 r. nr SKO.4140.232.1022.2024 Samorządowe Kolegium Odwoławcze w Krośnie uchyliło w całości decyzję Burmistrza Miasta {...}z dnia 23 czerwca 2025 r. nr PiOL.3120.4.21.2024:
1.stwierdzającą "o" nadpłatę w podatku od nieruchomości za 2018 r. w kwocie {...}zł w tym:
- nadpłatę podatku w części dotyczącej gruntów związanych z prowadzeniem działalności w kwocie {...}zł.;
- nadpłatę podatku w części dotyczącej budowli w kwocie {...}zł;
- niedopłatę podatku w części dotyczącej budynków związanych z prowadzeniem działalności w wysokości {...}zł;
2. określającą "O" wysokość zobowiązania z tytułu podatku od nieruchomości za 2018 r. w wysokości {...}zł;
3. odmawiającą "O" stwierdzenia nadpłaty w pozostałym zakresie z tytułu podatku od nieruchomości w kwocie {...}zł - nadpłata wynikająca z wniosku podatnika w zakresie instalacji i urządzeń wchodzących w skład tych instalacji, zapewniających możliwość użytkowania budynków, w których się znajdują zgodnie z ich przeznaczeniem.
Jak wynika z treści zaskarżonego rozstrzygnięcia i akt sprawy, pismem z dnia 22 grudnia 2023 r .P.B. , działający w imieniu spółki "O" (dalej:"O" spółka/skarżąca), za pośrednictwem platformy ePUAP, złożył wniosek o stwierdzenie nadpłaty w podatku od nieruchomości za 2018 r. w kwocie {...}zł wraz z korektą deklaracji. Wniosek obejmował swym zakresem:
I. zwolnienie z podatku od nieruchomości gruntów i budowli wchodzących w skład infrastruktury kolejowej;
II. obiekt stanowiący budynek, a wykazywany dotychczas do opodatkowania w części jako budynek i budowla.
III. obiekt stanowiący budowlę, a wykazywany dotychczas do opodatkowania w części jako budynek i budowla.
IV. instalacje i urządzenia wchodzące w skład tych instalacji, zapewniające możliwość użytkowania budynków, w których się znajdują zgodnie z ich przeznaczeniem.
Organ podatkowy wezwał stronę do przedłożenia:
1. dokumentów (innych niż umowa o świadczenie usług bocznicowych i dzierżawę nieruchomości z dnia 01.03.2015 r. i aneks do umowy z dnia 15.07.2015 r.) potwierdzających udostępnienie infrastruktury kolejowej (tj. bocznicy) przewoźnikowi kolejowemu,
2. regulaminu pracy bocznicy kolejowej "O" sp. z o. o., obowiązującego w okresie od 01.01.2018 r. do 31.12.2018 r.
3. dokumentacji księgowej tj. ewidencji środków trwałych podatnika, wykazujących obiekty zaliczone do budowli na dzień powstania obowiązku podatkowego tj. na 01.01.2018 r.
4. dokumentów przyjęcia środków trwałych o nr inwentarzowych: {...}oraz {...}wraz z ich charakterystyką oraz książkami obiektów budowlanych.
W odpowiedzi na wezwanie spółka przedłożyła następujące dokumenty:
- listy przewozowe;
- ewidencja środków trwałych w zakresie budowli według stanu na dzień 01.01.2018r.;
- dok "B "" o nr inw.{...};
- dokumentacja księgowa przyjęcia środka trwałego o nazwie "B" o nr inw.{...};
- książka obiektu budowlanego o nazwie "B" o nr inw.{...};
- książka obiektu budowlanego o nazwie "B" o nr inw.{...};
- operat techniczny z dnia 20 grudnia 2023 r. sporządzony przez uprawnionego geodetę Z.S. .
W dniu 21 lutego 2024 r. dokonano oględzin obiektów wskazanych we wniosku spółki "O" o stwierdzenie nadpłaty w podatku od nieruchomości za 2018 r, położonych w J.
Burmistrz Miasta {...} w decyzji z 10 maja 2024 r. nr{...}:
1. stwierdził nadpłatę w podatku od nieruchomości za 2018 rok w kwocie {...}zł. Nadpłata wynika z rozliczenia dotyczącego powierzchni budynków związanych z prowadzoną działalnością- zmniejszenie powierzchni o {...}m2 (budynek obróbki sadzy- {...}m2 oraz budynek wychwytu sadzy {...}m2 w związku z uznaniem obiektów za budowlę) przemnożone przez stawkę obowiązującą w 2018 tj. {...}zł, co daje kwotę {...}zł, pomniejszona o kwotę {...}zł- zwiększenie zobowiązania w zakresie budowli podlegających opodatkowaniu tj. obiektu wychwytu sadzy.
2. określił wysokość zobowiązania z tytułu podatku od nieruchomości za 2018 r. w wysokości {...}zł na co składa się podatek od :
- gruntów związanych z prowadzeniem działalności gospodarczej- {...}zł;
- budynków związanych z prowadzeniem działalności gospodarczej- {...}zł;
- budowli- {...}zł,
3. odmówił stwierdzenia nadpłaty w pozostałym zakresie z tytułu podatku od nieruchomości w kwocie {...}zł.
27 maja 2024 r. spółka złożyła odwołanie od powyższej decyzji.
31 października 2024 r. SKO decyzją nr SK0.4140.220.1070.2024 uchyliło ww. decyzję z 10 maja 2024 r. i przekazało sprawę organowi I instancji do ponownego rozpatrzenia.
23 czerwca 2025 r. Burmistrz Miasta {...}wydał ponowną decyzję w której:
1. stwierdził nadpłatę w podatku od nieruchomości za 2018 r. w kwocie {...}zł w tym:
- nadpłatę podatku w części dotyczącej gruntów związanych z prowadzeniem działalności w kwocie {...}zł.;
- nadpłatę podatku w części dotyczącej budowli w kwocie {...}zł;
- niedopłatę podatku w części dotyczącej budynków związanych z prowadzeniem działalności w wysokości {...}zł;
2. określił wysokość zobowiązania z tytułu podatku od nieruchomości za 2018 r. w wysokości {...}zł;
3. odmówił stwierdzenia nadpłaty w pozostałym zakresie z tytułu podatku od nieruchomości w kwocie {...}zł - nadpłata wynikająca z wniosku podatnika w zakresie instalacji i urządzeń wchodzących w skład tych instalacji, zapewniających możliwość użytkowania budynków, w których się znajdują zgodnie z ich przeznaczeniem.
Spółka wniosła odwołanie od ww. decyzji obejmując, zakresem zaskarżenia wyłącznie pkt 2 i 3 decyzji I instancji dotyczące odmowy stwierdzenia nadpłaty (tj. pkt 3 decyzji) oraz związanego z tą nadpłatą określenia wysokości zobowiązania podatkowego Spółki za 2018 r. (tj. pkt 2 decyzji). Poza zakresem zaskarżenia pozostawiała pkt 1 decyzji I instancji, w ramach którego częściowo stwierdzono nadpłatę wynikającą z wniosku o stwierdzenie nadpłaty w podatku od nieruchomości za 2018 r.
SKO decyzją z dnia 28 listopada 2025 r. nr SKO.4140.232.1022.2024 uchyliło w całości decyzję Burmistrza Miasta {...}z dnia 23 czerwca 2025 r. nr PiOL.3120.4.21.2024.
W uzasadnieniu decyzji SKO w pierwszej kolejności stwierdziło, że nie można podzielić stanowiska skarżącej spółki, że wobec wniesienia odwołania od decyzji I instancji tylko w części niekorzystnej dla podatnika, w pozostałej części decyzja ta stała się ostateczna, co wyłączało możliwość objęcia jej postępowaniem odwoławczym.
SKO wskazało, że w orzecznictwie sądów administracyjnych przyjmuje się wprawdzie dopuszczalność zaskarżenia odwołaniem jedynie części decyzji organu I instancji, jednakże dotyczyć to może jedynie sytuacji, kiedy taka decyzja ma podzielny charakter, a pozostałe zawarte w tej decyzji rozstrzygnięcia mogą samodzielnie funkcjonować w obrocie prawnym.
Organ odwoławczy wyjaśnił, że przedmiotem postępowania, w którym zapadła kwestionowana odwołaniem spółki decyzja Burmistrza Miasta {...} z 23 czerwca 2025 r., jest rozstrzygnięcie wniosku podatnika o stwierdzenie nadpłaty podatku od nieruchomości za 2018 r., na podstawie art. 75 § 4a ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa (tekst jednolity Dz. U. z 2025 r. poz. 111 ze zm., dalej: o.p.). W myśl tego przepisu, w przypadku kiedy organ podatkowy jedynie w części uwzględnia wniosek o stwierdzenie nadpłaty, to decyzja musi zawierać nie tylko wskazanie jaka kwota stanowi nadpłatę, ale też określenie wysokości zobowiązania w takim zakresie, w jakim powstanie nadpłaty jest związane ze zmianą wysokości zobowiązania podatkowego za dany rok oraz wskazanie kwoty, która zdaniem organu nie stanowi nadpłaty. Wszystkie te elementy są ze sobą związane i stanowią niepodzielną całość rozstrzygnięcia sprawy. Nie można zatem przyjmować, że wobec złożenia odwołania tylko od niektórych z nich w pozostałym zakresie decyzja staje się ostateczna. Stwierdzenie, jaka kwota stanowi w danym przypadku nadpłatę nie stanowi odrębnej, samodzielnej części decyzji wydawanej na podstawie art. 75 § 4a Ordynacji podatkowej, gdyż wysokość tej kwoty wpływa na treść pozostałych części rozstrzygnięcia (tj. na określenie wysokości zobowiązania i określenie kwoty, która nadpłaty nie stanowi). Samo stwierdzenie nadpłaty, która wystąpiła w odniesieniu do jednego roku podatkowego, nie może zatem samodzielnie funkcjonować w obrocie prawnym, co przesądza o tym, że niedopuszczalne jest ograniczenie postępowania odwoławczego tylko do pozostałych elementów decyzji wydanej na podstawie art. 75 § 4a o.p.