Uzasadnienie
1. Postępowanie przed organami podatkowymi.
1.1. Przedmiotem skargi A. G. (dalej: Strona, Podatnik, Skarżący) jest decyzja Dyrektora Izby Administracji Skarbowej we Wrocławiu (dalej: DIAS, organ drugiej instancji, organ odwoławczy) z dnia 25 kwietnia 2025 r., nr 0201-IOA.4103.2.2025.15 utrzymująca w mocy decyzję Naczelnika Urzędu Skarbowego w Kłodzku (dalej: NUS, organ podatkowy, organ pierwszej instancji) z dnia 16 grudnia 2024 r., nr 0209-SPV.4103.37.2022, w której organ I instancji określił Stronie kwotę zwrotu podatku od towarów i usług (dalej: VAT) za czerwiec 2019 r. w wysokości 0,00 zł, zobowiązanie podatkowe za grudzień 2019 r. w wysokości 28,00 zł, za styczeń 2020 r. w wysokości 28,00 zł, za luty 2020 r. w wysokości 28,00 zł oraz umorzył postępowanie za miesiące od lipca do listopada 2019 r.
1.2. W zaskarżonej decyzji wskazano, że Podatnik – prowadzi działalność w zakresie usług medycznych – zakupił lokale nr [...] i [...] oraz miejsca postojowe nr [...] i [...] w garażu wielostanowiskowym znajdujące się w budynku położonym we W. przy ul. [...], które uznał za wykorzystywane w jego działalności gospodarczej, odliczając następnie podatek naliczony wynikający z faktur otrzymanych od sprzedawcy.
Organ podatkowy pierwszej instancji ustalił jednak, że lokale te nie były wykorzystywane ani w działalności medycznej Strony, ani też nie były oferowane na komercyjny wynajem, a zatem nie służyły do działalności opodatkowanej VAT. Z tego powodu odmówił Podatnikowi uznania wynikającego z jego rozliczeń zwrotu VAT i wydając decyzję z dnia 14 kwietnia 2023 r., nr 0209-SPV.4103.37.2022, określił prawidłową – w opinii NUS – kwotę zwrotu podatku za czerwiec 2019 r. oraz zobowiązanie podatkowe za miesiące od grudnia 2019 r. do lutego 2020 r., umarzając jednocześnie postępowanie za miesiące od lipca do listopada 2019 r.
1.3. Na skutek odwołania Podatnika się od ww. decyzji, Organ drugiej instancji – postanowieniem z dnia 20 lipca 2023 r., nr 0201-IOA.4103.5.2023.2 – stwierdził niedopuszczalność odwołania, dopatrując się w sprawie nieprawidłowych doręczeń.
Wyjaśnił, że prawidłowo wszczęto przeprowadzoną wobec Podatnika kontrolę podatkową i prawidłowo doręczono bezpośrednio jemu w dniu 6 maja 2022 r. protokół kontroli. Prawidłowo także dokonano doręczenia pisma o sposobie rozpatrzenia zastrzeżeń do protokołu, kierując je tym razem do doradcy podatkowego Strony, który w terminie 14 dni wniósł zastrzeżenia, dołączając do nich stosowne pełnomocnictwo szczególne. Prawidłowo także – zdaniem DIAS – organ pierwszej instancji wszczął, postanowieniem z dnia 15 września 2022 r., wobec Strony postępowanie podatkowe – doręczając postanowienie bezpośrednio Podatnikowi, pomimo tego, że w kontroli podatkowej ustanowił on pełnomocnika w osobie doradcy podatkowego.
W opinii organu odwoławczego nieprawidłowo natomiast, NUS już w postępowaniu podatkowym nie uznał pełnomocnictwa udzielonego doradcy podatkowemu, które wpłynęło do organu w dniu 1 grudnia 2022 r. W skutecznie wszczętym postępowaniu podatkowym nieprawidłowo zatem od tej daty organ pierwszej instancji pomijał pełnomocnika Strony, między innymi, doręczając bezpośrednio jej postanowienie o wyznaczeniu terminu do zapoznania się z materiałem dowodowym oraz decyzję z dnia 14 kwietnia 2023 r.
W tym stanie rzeczy, w opinii organu odwoławczego, decyzja podatkowa z dnia 14 kwietnia 2023 r., nie weszła do obrotu prawnego i w konsekwencji odwołanie od niej należało uznać za niedopuszczalne.
1.4. Powyższą ocenę DIAS potwierdził tutejszy Sąd w wyroku z dnia 9 maja 2024 r. o sygn. akt 793/23, którym oddalił skargę Strony na ww. postanowienie organu odwoławczego, powołując się w uzasadnieniu wyroku na uchwałę składu siedmiu sędziów Naczelnego Sądu Administracyjnego z dnia 25 kwietnia 2022 r. o sygn. akt II FPS 1/22, przesądzającą, że pomimo złożenia pełnomocnictwa szczególnego w postępowaniu kontrolnym, czy też po jego zakończeniu na etapie zastrzeżeń do protokołu kontroli - konieczne jest, stosownie do art. 138e § 3 ustawy Ordynacja podatkowa, jego kolejne złożenie do akt sprawy konkretnego postępowania przed organem podatkowym. Pełnomocnik co do zasady przystępuje do postępowania, które musi się już toczyć, a zabezpieczeniu interesów strony w szerszym zakresie służy zaś pełnomocnictwo ogólne.
1.5. Po zapoznaniu się ze stanowiskiem organu odwoławczego i Sądu, organ pierwszej instancji przyjął, że postępowanie podatkowe zostało wszczęte prawidłowo przez doręczenie bezpośrednio Stronie postanowienia w tym przedmiocie. Następnie powtórzył z udziałem doradcy podatkowego czynności, w których uprzednio go pominął, kierując pisma do Strony za jego pośrednictwem. W szczególności pismem z dnia 10 października 2024 r. wezwano Podatnika do złożenia wyjaśnień w sprawie. Ustosunkowując się do wezwania, doradca podatkowy stwierdził, że organ pierwszej instancji nie wszczął postępowania podatkowego, gdyż nie doręczył postanowienia o jego wszczęciu ustanowionemu pełnomocnikowi. Zdaniem Strony, organ podatkowy pierwszej instancji nie może zatem wzywać jej do udzielenia wyjaśnień. Następnie NUS, pismem z dnia 21 października 2024 r., wezwał Podatnika do osobistego stawienia się w celu złożenia zeznań w charakterze strony. Pełnomocnik został zawiadomiony o wyznaczonym terminie przeprowadzenia dowodu z zeznań strony. W reakcji na wezwanie doradca podatkowy pisemnie poinformował, że Strona podtrzymuje stanowisko uprzednio wyrażone, nadto korzysta z przysługującego jej prawa i nie wyraża zgody na przesłuchanie, zatem nie stawi się na przesłuchanie w terminie wskazanym w wezwaniu.
1.6. W tym stanie rzeczy organ pierwszej instancji, wskazaną na wstępie decyzją z 16 grudnia 2024 r., rozpatrując sprawę ponownie, zakwestionował dokonane przez Podatnika sporne odliczenie VAT i ponownie określił mu kwotę zwrotu VAT za czerwiec 2019 r. w wysokości 0,00 zł, zobowiązanie podatkowe za grudzień 2019 r. w wysokości 28,00 zł, za styczeń 2020 r. w wysokości 28,00 zł, za luty 2020 r. w wysokości 28,00 zł oraz umorzył postępowanie za miesiące od lipca do listopada 2019 r.
1.7. Po rozpatrzeniu zarzutów odwołania – zasadniczo sprowadzających się do twierdzeń, że organ podatkowy pierwszej instancji w sposób nieprawidłowy zainicjował wszczęcie postępowania podatkowego, nie doręczając postanowienia o wszczęciu postępowania ustanowionemu pełnomocnikowi, co spowodowało, że Strona nie brała udziału w postępowaniu podatkowym i nie można było wydać decyzji w postępowaniu, którego nie wszczęto – DIAS decyzję NUS utrzymał w mocy.
W uzasadnieniu swojego rozstrzygnięcia organ odwoławczy w pierwszej kolejności wykluczył zaistnienie przedawnienia. W zakresie deklaracji VAT-7 za czerwiec 2019 r. zwrócił uwagę, że Podatnik złożył ją w dniu 8 sierpnia 2019 r., deklarując w niej kwotę do zwrotu na rachunek w terminie 180 dni wysokości 94.397,00 zł, którego upływ przypadał zatem na dzień 4 lutego 2020 r. Powołując się na uchwałę siedmiu sędziów Naczelnego Sądu Administracyjnego z dnia 29 czerwca 2009 r. o sygn. akt I FPS 9/08, DIAS wyjaśnił, że termin przedawnienia prawa do zwrotu winien wynosić 5 lat i powinien być liczony od następnego roku, w którym zwrot miał być dokonany, co oznacza, że w zakresie przedmiotowej deklaracji organy obu instancji mogły orzekać do dnia 31 grudnia 2025 r.
DIAS wskazał nadto na zawieszenie biegu terminu przedawnienia w oparciu o art. 70 § 6 pkt 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2025 r., poz. 111 ze zm.; dalej O.p.) z uwagi na wszczęcie – na mocy postanowienia z dnia 22 września 2023 r., o czym pełnomocnik Strony został zawiadomiony – dochodzenia w sprawie o czyn polegający na podaniu w deklaracjach VAT-7 za okres od czerwca 2019 r. do lutego 2020 r. danych niezgodnych ze stanem rzeczywistym i wprowadzeniem w błąd właściwego organu podatkowego, w związku z nierzetelnym prowadzeniem ksiąg za okres od czerwca 2019 r. do lutego 2020 r. poprzez ujęcie w tych księgach faktur zakupu VAT nieruchomości, to jest lokali mieszkalnych i miejsc parkingowych zawierających kwoty podatku naliczonego niezwiązanego z czynnościami opodatkowanymi, tym samym narażając na nienależny zwrot podatkowej należności publicznoprawnej za miesiąc czerwiec w kwocie 94.397,00 zł. W związku z powyższym bieg terminu przedawnienia zobowiązania podatkowego, dotyczącego VAT za okres od czerwca 2019 do lutego 2020 r. uległ zawieszeniu z dniem 22 września 2023 r. Organ odwoławczy ocenił przy tym, że wszczęcie postępowania karnego skarbowego nie było instrumentalne, wskazując na szereg dokonanych w nim czynności, które zmierzały do realizacji rzeczywistych celów tego postępowania, będąc nakierowanymi na ustalenie sprawstwa zarzucanych czynów i zastosowanie sankcji karnej.
W odniesieniu do prawa do odliczenia DIAS, po przeanalizowaniu materiału zebranego w toku czynności sprawdzających, kontroli oraz postępowania podatkowego, potwierdził ocenę organu podatkowego pierwszej instancji, że Podatnik nie miał i nie ma zamiaru wykorzystywać nabytych nieruchomości do generowania sprzedaży opodatkowanej, w związku z czym, zgodnie z art. 86 § ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz.U. z 2018 r., poz. 2174 ze zm.; dalej ustawa o VAT), nie miał on prawa do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego z tytułu ich nabycia. Organ odwoławczy zauważył, że Strona nie kwestionuje żadnych ustaleń podanych w zaskarżonej decyzji w zakresie ewidencjonowania sprzedaży, zakupów dla potrzeb VAT oraz rozliczenia podatku za kontrolowany okres dokonanych przez organ podatkowy pierwszej instancji. Zamiast tego Strona w odwołaniu zarzuca natomiast, że nie doszło do skutecznego wszczęcia postępowania podatkowego, co powoduje – jej zdaniem – że nie można było wydać decyzji w przedmiotowej sprawie. DIAS wyjaśnił w tym zakresie, że organ pierwszej instancji prawidłowo skierował bezpośrednio do Strony postanowienie z dnia 15 września 2022 r. o wszczęciu postępowania podatkowego z pominięciem doradcy podatkowego umocowanego i działającego w kontroli podatkowej. Przesądza o tym bowiem uchwała NSA z dnia 22 kwietnia 2022 r. o sygn. akt II FPS 1/22, w której wyjaśniono, że pełnomocnictwo szczególne umocowuje pełnomocnika do działania w konkretnej sprawie materialnej, a dokument pełnomocnictwa – dla wywarcia skutków procesowych – musi być złożony do akt konkretnej sprawy.