Uzasadnienie
Przedmiotem skargi M. spółka komandytowa z siedzibą we W. (dalej: Strona, Skarżąca, Spółka) jest postanowienie Dyrektora Izby Administracji Skarbowej we Wrocławiu (dalej: DIAS, organ odwoławczy) z 1 sierpnia 2025 r. nr 0201-IER.7010.60.2025, utrzymujące w mocy postanowienie Naczelnika Dolnośląskiego Urzędu Skarbowego we Wrocławiu (dalej: NDUS, organ I instancji) z 8 maja 2025 r. nr 0271-SER.7015.73.2025 w przedmiocie zaliczenia części zwrotu podatku od towarów i usług za luty 2025 r.
Jak wynika z akt sprawy, 10 marca 2025 r. do NDUS wpłynęła deklaracja Spółki dla podatku od towarów i usług za luty 2025 r., w której wykazano kwotę do zwrotu na rachunek bankowy Strony w wysokości 2 095 182 zł. 14 marca 2025 r. Spółka złożyła do NDUS korektę zeznania o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty) i należnego podatku dochodowego od osób prawnych za 2022 r. (CIT-8), z którego wynikały należne zaliczki za poszczególne miesiące 2022 r. oraz podatek do zapłaty w wysokości 138 280,00 zł. Tego samego dnia Spółka złożyła zeznanie o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty) i należnego podatku dochodowego od osób prawnych za 2023 r. (CIT-8), z którego wynikały należne zaliczki za miesiące od stycznia do czerwca 2023 r. oraz za wrzesień, listopad i grudzień 2023 r., a także podatek do zapłaty w wysokości 128 603,00 zł. 18 marca 2025 r. wpłacono na poczet zobowiązania w podatku dochodowym od osób prawnych za 2022 r. kwotę 138 280,00 zł, zaś na poczet zobowiązania w podatku dochodowym od osób prawnych za 2023 r. kwotę 128 603,00 zł. 31 marca 2025 r. Spółka także zeznanie o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty) i należnego podatku dochodowego od osób prawnych za 2024 r. (CIT-8), z którego wynikała należna zaliczka za miesiące od stycznia do grudnia 2024 r. oraz podatek do zapłaty w wysokości 12 631,00 zł. W wyniku rozliczenia dokonanych w ciągu roku podatkowego wpłat na poczet należnych zaliczek za poszczególne okresy po złożeniu zeznania podatkowego za 2024 r., pozostała zaległość w podatku dochodowym od osób prawnych z tytułu zaliczki za grudzień 2024 r. w wysokości 10 043,00 zł. 1 kwietnia 2025 r. wpłacono na poczet zobowiązania w podatku dochodowym od osób prawnych za 2024 r. kwotę 12 631,00 zł. Zaległości w podatku dochodowym od osób prawnych za 2022 r., 2023 r. i za grudzień 2024 r. (zaliczka na podatek) oraz bieżące zobowiązanie w tym podatku za 2024 r. wygasły wskutek zaliczenia z dniem 10 marca 2025 r. części ww. zwrotu podatku od towarów i usług za luty 2025 r. w wysokości 373 931,00 zł. Na dzień dokonania rozliczenia zwrotu Spółka nie uregulowała w pełnej wysokości w obowiązującym terminie płatności zaliczek na podatek dochodowy od osób prawnych za: marzec 2022 r. w wysokości 11 967 zł, kwiecień 2022 r. w wysokości 11 278 zł, maj 2022 r. w wysokości 11 351 zł, czerwiec 2022 r. w wysokości 4 657 zł, lipiec 2022 r. w wysokości 8 440 zł, sierpień 2022 r. w wysokości 13 579 zł, wrzesień 2022 r. w wysokości 9 102 zł, październik 2022 r. w wysokości 18 066 zł, listopad 2022 r. w wysokości 44 053 zł, grudzień 2022 r. w wysokości 5 787 zł, styczeń 2023 r. w wysokości 11 064 zł, luty 2023 r. w wysokości 18 948 zł, marzec 2023 r. w wysokości 26 631 zł, kwiecień 2023 r. w wysokości 21 464 zł, maj 2023 r. w wysokości 19 106 zł, czerwiec w wysokości 2023 r. 3 847 zł, wrzesień 2023 r. w wysokości 928 zł, listopad 2023 r. w wysokości 1 821 zł, grudzień 2023 r. w wysokości 24 794 zł oraz posiadała zaległość w z tytułu podatku dochodowego od osób prawnych za okres od 1 stycznia 2022 r. do 31 grudnia 2022 r. w wysokości 13 8280 zł; zaległość w z tytułu podatku dochodowego od osób prawnych za okres od 1 stycznia 2023 r. do 31 grudnia 2023 r. w wysokości 128 603 zł; zaległość tytułu zaliczki na podatek dochodowy od osób prawnych za grudzień 2024 r. w wysokości 10 043 zł oraz wymagalne zobowiązanie z tytułu podatku dochodowego od osób prawnych za okres od 1 stycznia 2024 r. do 31 grudnia 2024 r. w wysokości 12 631 zł. Wobec tego NDUS, powołując się na art. 76 § 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 roku Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2025 r.,poz. 111 dalej O.p.), art. 76a § 1 O.p., art. 76b § 1 O.p., art. 51 § 2 O.p., art. 53 § 1, § 2 i § 4 O.p., dokonał zaliczenia części zwrotu podatku od towarów i usług za luty 2025 r. w wysokości 373 931 zł na poczet odsetek za zwłokę od nieuiszczonej w pełnej wysokości zaliczki na podatek dochodowy od osób prawnych za marzec, kwiecień, maj, czerwiec, lipiec, sierpień, wrzesień, październik, listopad i grudzień 2022 r.; podatku dochodowego od osób prawnych za okres od 1 stycznia 2022 r. do 31 grudnia 2022 r. na należność główną w kwocie 138 280 zł oraz odsetki za zwłokę; odsetek za zwłokę od nieuiszczonej w pełnej wysokości zaliczki na podatek dochodowy od osób prawnych za styczeń, luty, marzec, kwiecień, maj, czerwiec, wrzesień, listopad i grudzień 2023 r.; podatku dochodowego od osób prawnych za okres od 1 stycznia 2023 r. do 31 grudnia 2023 r. na należność główną w kwocie 128 603 zł oraz odsetki za zwłokę; zaliczki na podatek dochodowy od osób prawnych za grudzień 2024 r. na należność główną w kwocie 10 043 zł oraz odsetki za zwłokę; podatku dochodowego od osób prawnych za okres od 1 stycznia 2024 roku do 31 grudnia 2024 r. na należność główną w kwocie 12 631 zł z dniem 31 marca 2025 r.
Po rozpoznaniu zażalenia DIAS utrzymał w mocy zaskarżone postanowienie wskazując m.in., że pismem z 8 kwietnia 2025 r. Spółka wniosła o wydanie postanowienia w sprawie zaliczenia nadwyżki podatku naliczonego nad należnym na poczet zaległości podatkowych w podatku dochodowym od osób prawnych za 2022 r. i 2023 r. wraz z odsetkami za zwłokę, wskutek czego NDUS wydał ww. postanowienie z 8 maja 2025 r. Jak wskazał DIAS, w wyniku złożenia 10 marca 2025 r. deklaracji dla podatku od towarów i usług za luty 2025 r. Spółce przysługiwał zwrot podatku na rachunek bankowy w wysokości 2 095 182,00 zł. 14 marca 2025 r. Spółka złożyła korektę zeznania podatkowego w podatku dochodowym od osób prawnych za 2022 r. oraz zeznanie podatkowe w tym podatku za 2023 r., co spowodowało powstanie zaległości podatkowych z tytułu: odsetek za zwłokę od nieuregulowanych w terminie płatności zaliczek na podatek dochodowy od osób prawnych od marca do grudnia 2022 r., podatku dochodowego od osób prawnych za rok 2022, odsetek za zwłokę od nieuregulowanych w terminie płatności zaliczek na podatek dochodowy od osób prawnych od stycznia do grudnia 2023 r i za 2023 r. 31 marca 2025 r. Spółka złożyła zeznanie w podatku dochodowym od osób prawnych za 2024 r., w którym wykazano m.in. należną zaliczkę za grudzień 2024 r., która, w wyniku rozliczenia dokonanych w ciągu roku podatkowego wpłat na poczet należnych zaliczek za poszczególne okresy po złożeniu zeznania podatkowego za 2024 r., nie została zapłacona w terminie w wysokości 10 043,00 zł, a także wykazano zobowiązanie do zapłaty za 2024 r. w wysokości 12 631,00 zł. Zaległości w podatku dochodowym od osób prawnych za 2022 r., 2023 r. i za grudzień 2024 r. (zaliczka na podatek) oraz bieżące zobowiązanie w tym podatku za 2024 r. - wygasły wskutek zaliczenia części zwrotu podatku od towarów i usług za luty 2025 r. w wysokości 373 931,00 zł na ich poczet z dniem 10 marca 2025 r. DIAS wskazał następnie, że w sytuacji, gdy wystąpił jednocześnie zwrot podatku i zaległe zobowiązanie podatkowe w podatku dochodowym od osób prawnych, przepis art. 76 § 1 O.p. obligował organ podatkowy do zaliczenia z urzędu zwrotu podatku na poczet zaległości podatkowych, nie dając organowi podatkowemu żadnego wyboru w tym zakresie. W przypadku zaistnienia zwrotu podatku, jeśli podatnik ma zaległe zobowiązania podatkowe, to organ podatkowy musi zaliczyć zwrot na ich poczet zaległych zobowiązań. Postanowienie w tym przedmiocie ma charakter deklaratoryjny i nie tworzy nowej sytuacji prawnej, lecz potwierdza jej wcześniejsze powstanie z mocy prawa.