W uzasadnieniu prawnym decyzji Wójt przywołał przepis art. 1a ust. 1 pkt 3 u.p.o.l., w którym zawarta została definicja pojęcia "gruntów, budynków i budowli związanych z prowadzeniem działalności gospodarczej" jako "gruntów, budynków i budowle będących w posiadaniu przedsiębiorcy lub innego podmiotu prowadzącego działalność gospodarczą" oraz odnoszące się do interpretacji tego pojęcia tezy wyroków NSA z dnia 15 grudnia 2021 r. o sygn. akt III FSK 4061/21 oraz 20 sierpnia 2024 r. o sygn. akt III FSK 1534/23 (te i inne orzeczenia sądów administracyjnych opublikowane są w Centralnej Bazie Orzeczeń Sądów Administracyjnych – CBOSA).
Końcowo w uzasadnieniu decyzji organ podatkowy wskazał, że zgodnie z art. 81b § 2a Ordynacji podatkowej – korekta złożona wraz z wnioskiem o stwierdzenie nadpłaty nie wywołuje skutków prawnych w razie odmowy stwierdzenia nadpłaty w całości lub w części oraz w razie umorzenia postępowania w związku z wycofaniem wniosku.
1.3. Mając powyższe na uwadze Kolegium, w wyniku rozpatrzenia złożonego w sprawie odwołania, uznało, że odmowa stwierdzenia przez Wójta nadpłaty z tytułu podatku od nieruchomości, należnego za 2019 rok od Spółki z o.o. jest uprawniona.
W uzasadnieniu swojego rozstrzygnięcia SKO podkreśliło, że z materiału dowodowego wynika niezbicie, że obiekty, opisane przez Spółkę w złożonym w dniu 20 maja 2021 r. wniosku o nadpłatę, jako podlegające podatkowi od nieruchomości w innych stawkach niż związane z prowadzeniem działalności gospodarczej, zostały nabyte przez Spółkę na podstawie umowy przeniesienia własności zorganizowanej części przedsiębiorstwa, zawartej w dniu 27 maja 2019 r. w formie aktu notarialnego, repertorium [...] nr [...]. Zdaniem organu odwoławczego nie ulega wątpliwości fakt, że wszystkie grunty, budynki i budowle, wykazane w § 1 tej umowy, zgodnie z oświadczeniem zawartym w § 4 umowy, weszły w skład "zorganizowanej części przedsiębiorstwa" Podatnika w rozumieniu nadanemu temu pojęciu w przepisie art. 551 Kodeksu cywilnego. W ślad za organem I instancji, również Kolegium ustaliło, że zgodnie z treścią wpisu Spółki do Krajowego Rejestru Sądowego (KRS), pod numerem [...], przedmiot jej działalności gospodarczej obejmuje: 1) produkcję papieru i tektury, 2) produkcję masy włóknistej, papieru i tektury, 3) produkcję wyrobów z drewna, korka, słomy i materiałów używanych do wyplatania, 4) handel hurtowy, z wyłączeniem handlu pojazdami samochodowymi, 5) handel detaliczny, z wyłączeniem handlu detalicznego pojazdami samochodowymi, 6) działalność wspomagającą usługi finansowe, z wyłączeniem ubezpieczeń i funduszów emerytalnych, 7) działalność rachunkowo-księgową, doradztwo podatkowe, 8) doradztwo związane z zarządzaniem, 9) działalność związaną z administracyjną obsługą biura i pozostałą działalność wspomagającą prowadzenie działalności gospodarczej. Zdaniem SKO także i z pozostałego zgromadzonego w sprawie materiału dowodowego wywieść należy, że w 2019 roku Podatnik nie tylko znajdował się w posiadaniu nabytych powyższym aktem notarialnym gruntów, budynków oraz budowli, lecz również te, ujęte w złożonym wniosku o nadpłatę podatkową, wprowadził do ewidencji środków trwałych, nadając im opisane w uzasadnieniu wydanej w pierwszej instancji decyzji oznaczenia identyfikacyjne.
Organ odwoławczy ocenił, że Wójt zrealizował wytyczne zawarte w uprzedniej kasatoryjnej decyzji Kolegium z dnia 22 kwietnia 2024 r., przeprowadzając w dniu 9 lipca 2024 r. czynność oględzin budynków, położonych w D. w obrębie działek oznaczonych numerami ewidencyjnymi: [...], [...], [...], [...], [...], [...] oraz [...], w tym obiektów, które winny być – zdaniem Strony – w 2019 roku opodatkowane w innych stawkach, niż związane z prowadzeniem działalności gospodarczej. SKO zauważyło, że wprawdzie w uzasadnieniu decyzji organu I instancji wskazano, że dokonane w trakcie tej czynności ustalenia, jako czynione w 2024 roku, nie w pełni odpowiadają stanowi faktycznemu, panującemu na opodatkowanej nieruchomości w 2019 roku, jednakże w trakcie dokonywania oględzin stwierdzono przykładowo, że pomieszczenia niektórych obiektów (budynków: rozwłókniacza, maszyny parowej - laboratorium, rozdzielni elektrycznej, trafostacji, magazynowego, socjalnego i usługowego), których stan techniczny, według Spółki, miał uniemożliwiać prowadzenie statutowej działalności gospodarczej, są przez nią jednak na te cele wykorzystywane. Kolegium jednakowoż przeprowadzonemu w powyższej dacie dowodowi z oględzin przypisało znaczenie pomocnicze oraz uzupełniające w stosunku do uprzednich dowodów, które wykazały, że ogół budynków, objętych złożonym w tej sprawie wnioskiem o nadpłatę, został nabyty przez Spółkę dla celów prowadzonej działalności gospodarczej i w sensie podatkowym wszedł w skład jej majątku rzeczowego.
Organ odwoławczy zauważył ponadto, że w okresie objętym złożonym wnioskiem wykazane w nich obiekty nie były prawnie wyłączone z użytkowania, w sposób, unormowany w przepisie art. 1a ust. 2a u.p.o.l. Z materiałów sprawy wynika bowiem, że dopiero decyzją z dnia 6 października 2023 r. nr 462/2023, Starosta K. zatwierdził projekt rozbiórki oraz udzielił Spółce pozwolenia na rozbiórkę trzech budynków znajdujących się na terenie F.(1) w D., a konkretnie budynku kotłowni, budynku magazynowego oraz budynku rozdzielni elektrycznej. Jednocześnie, w ocenie Kolegium, nawet przejściowe niewykorzystywanie tych obiektów w 2019 roku przez Stronę do celów prowadzonej działalności gospodarczej nie stoi w sprzeczności z koniecznością ich opodatkowania w stawkach związanych z prowadzeniem działalności gospodarczej. Opierając się o informacje podane przez organ I instancji, SKO wskazało, że Spółka dokonała wyceny posiadanego majątku nieruchomego przez uprawnionego rzeczoznawcę majątkowego, a ze sporządzonych operatów wynika, że planuje ona zakończyć prowadzenie nierentownej działalności gospodarczej związanej z przetwórstwem papieru i oddać przedmiot wyceny w dzierżawę innym podmiotom. To z kolei oznacza, zdaniem organu odwoławczego, że wykorzystywanie tych obiektów do celów działalności gospodarczej nie może być uznane za jedynie "przejściowe", lecz zamiarem Podatnika jest dalsze czerpanie z nich korzyści majątkowej, tym razem w formie uzyskiwanego czynszu dzierżawnego.
Opierając się na powyższych ustaleniach, Kolegium uznało, że dopuszczenie w niniejszej sprawie dodatkowych dowodów, ponad dotychczas przeprowadzone, w tym z przesłuchania w charakterze świadków, wskazanych przez Spółkę, obecnych bądź byłych członków jej zarządu jest zbędne, skutkując jedynie nieuzasadnionym przedłużeniem prowadzonego postępowania. Zdaniem SKO, analogicznie odnieść się należało ponadto do wniosku dowodowego Strony o przeprowadzenie dowodu z akt upadłościowych, dotyczących zakupu przez Spółkę działek o numerach ewidencyjnych [...], [...], [...], [...], [...], [...] oraz [...].
2. Postępowanie przed Sądem pierwszej instancji.
2.1. Nie zgadzając się z powyższym rozstrzygnięciem Kolegium, Spółka zaskarżyła je w całości, formułując we wniesionej do tutejszego Sądu skardze zarzuty analogiczne do tych, które podniesiono już w odwołaniu od rozstrzygnięcia organu I instancji, odnoszące się do naruszenia:
1) art. 187 § 1 w związku z art. 122 i art. 120 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2025 r., poz. 111 ze zm.; dalej Ordynacja podatkowa lub O.p.), poprzez niezebranie w sprawie w sposób wyczerpujący i kompleksowy materiału dowodowego, oraz niepodjęcie wszelkich niezbędnych działań w celu dokładnego wyjaśnienia stanu faktycznego sprawy, w szczególności zaś:
a) nieprzesłuchanie w charakterze strony J. M. (prezesa zarządu spółki z o.o. będącej komplementariuszem Skarżącej) na okoliczność stanu technicznego nieruchomości posiadanych przez Stronę w analizowanym okresie (2019 rok), w szczególności na okoliczność, które z nich były wykorzystywane (ewentualnie mogły być potencjalnie wykorzystywane) do prowadzenia działalności gospodarczej przez Spółkę (naruszenie art. 199 O.p.),
b) nieprzesłuchanie w charakterze świadka K. J. (byłego wiceprezesa zarządu spółki z o.o. będącej komplementariuszem Skarżącej) na okoliczność stanu technicznego nieruchomości posiadanych przez Stronę w analizowanym okresie (2019 rok), w szczególności na okoliczność, które z nich były wykorzystywane (ewentualnie mogły być potencjalnie wykorzystywane) do prowadzenia działalności gospodarczej przez Spółkę (naruszenie art. 181 O.p.),
c) nieprzeprowadzenie w sposób kompleksowy oględzin nieruchomości stanowiących działki o numerach ewidencyjnych [...], [...], [...], [...], [...], [...] oraz [...] w dniu 9 lipca 2024 r., w tym w szczególności poprzez:
- ograniczenie się jedynie do bardzo lakonicznego opisu wnętrza poszczególnych budynków w protokole oględzin, z którego w zdecydowanej większości przypadków nie sposób wywnioskować, który z opisywanych budynków służy (lub może służyć) do prowadzenia działalności gospodarczej,
- nieprzeprowadzenie oględzin w odniesieniu do budynku kotłowni - budynek stożka 1 oraz budynek stożka 2 (naruszenie art. 180 § 1, art. 181 oraz art. 198 § 1 O.p.),
- niezwrócenie się do właściwego sądu upadłościowego o przekazanie dokumentów dotyczących zakupu przez Podatnika działek o numerach ewidencyjnych [...], [...], [...], [...], [...], [...] oraz [...] w toku postępowania upadłościowego celem ustalenia stanu faktycznego ww. nieruchomości w analizowanym okresie, to jest za 2019 rok (naruszenie art. 180 § 1 w związku z art. 181 O.p.),
-- co w konsekwencji spowodowało niezgodne ze stanem rzeczywistym przyjęcie, że wszystkie nieruchomości będące w posiadaniu Podatnika w analizowanym okresie (2019 rok) były co najmniej w sposób przejściowy wykorzystywane do prowadzenia działalności gospodarczej, podczas gdy zgromadzenie w sprawie pełnego materiału dowodowego spowodowałoby prawidłowe ustalenie, że Podatnik wykorzystywał (i potencjalnie mógł wykorzystywać) w działalności gospodarczej jedynie część nieruchomości, to jest te, które zostały wskazane przez niego we wniosku o stwierdzenie nadpłaty jako wykorzystywane do prowadzenia działalności gospodarczej,
2) art. 120 w związku z art. 122 w związku z art. 187 § 1 i art. 188 O.p., poprzez nieuwzględnienie wniosków dowodowych Podatnika o:
a) przesłuchanie w charakterze strony J. M. (prezesa zarządu spółki z o.o. będącej komplementariuszem Skarżącej),
b) przesłuchanie w charakterze świadka K. J. (byłego wiceprezesa zarządu spółki z o.o. będącej komplementariuszem Skarżącej),
c) zwrócenie się do właściwego sądu upadłościowego o przekazanie dokumentów dotyczących zakupu przez podatnika działek o numerach ewidencyjnych [...], [...], [...], [...], [...], [...] oraz [...] w toku postępowania upadłościowego,
- wszystkie na okoliczność ustalenia stanu technicznego ww. nieruchomości oraz na okoliczność ustalenia, które z nich były wykorzystywane (ewentualnie mogły być potencjalnie wykorzystywane) do prowadzenia działalności gospodarczej przez Spółkę w analizowanym okresie (2019 rok), podczas gdy ww. wnioski dowodowe dotyczyły okoliczności mających istotne znaczenie dla sprawy, które to okoliczności nie były w wystarczający sposób stwierdzone innymi dowodami przeprowadzonymi w sprawie, a co w konsekwencji spowodowało niezgodne ze stanem rzeczywistym przyjęcie, że wszystkie nieruchomości będące w posiadaniu podatnika w analizowanym okresie (2019 rok) były co najmniej w sposób przejściowy wykorzystywane do prowadzenia działalności gospodarczej, podczas gdy zgromadzenie w sprawie pełnego materiału dowodowego spowodowałoby prawidłowe ustalenie, że Podatnik wykorzystywał (i potencjalnie mógł wykorzystywać) w działalności gospodarczej jedynie część nieruchomości, to jest te, które zostały wskazane przez niego we wniosku o stwierdzenie nadpłaty jako wykorzystywane do prowadzenia działalności gospodarczej,
3) art. 122 w związku z art. 187 § 1 i art. 191 O.p., poprzez rozpatrzenie zgromadzonego materiału dowodowego w sposób wybiórczy, niezgodny z zasadami logiki, wiedzy i doświadczenia życiowego, z naruszeniem zasady swobodnej oceny dowodów, polegające w szczególności na:
a) pominięciu dowodów z dokumentacji fotograficznej, załączonej przez Podatnika do odwołania z dnia 11 października 2021 roku, na okoliczność stanu technicznego budynków oraz braku możliwości prowadzenia w nich działalności gospodarczej,
b) częściowym pominięciu dowodu z protokołu z oględzin z dnia 9 lipca 2024 roku (oraz załączonej do niego dokumentacji fotograficznej) w zakresie, w jakim z ww. protokołu wynika, że część budynków będących w posiadaniu Spółki jest w stanie technicznym niepozwalającym na prowadzenie działalności gospodarczej (obecnie oraz w okresie analizowanym), w szczególności zaś: budynek magazynu ogólnego ("lokomotywa") - działka [...], budynek przepompowni rzecznej - działka [...], budynek - magazynek podręczny - działka [...], budynek maszyn papierniczych - działka [...], budynek magazynu ogólnego - działka [...], budynek maszyny parowej - laboratorium (działka [...]), budynek młynów i zagęszczarek pomieszczeń magazynowych (działka [...]), budynek - magazyn - budynek produkcyjno-magazynowy (działka [...]),
c) dokonaniu ustalenia wewnętrznie sprzecznego i niezgodnego z zasadami logiki, poprzez wskazanie, że:
- oględziny nieruchomości przeprowadzone w dniu 9 lipca 2024 r. nie przedstawiają stanu technicznego i użytkowego nieruchomości, właściwego dla analizowanego okresu (2019 rok),
przy jednoczesnym przyjęciu, że:
- skoro w 2024 roku niektóre z pomieszczeń były w jakiś sposób wykorzystywane do działalności gospodarczej Podatnika, to również w 2019 roku te pomieszczenia były do takiej działalności przeznaczone,
d) dokonaniu ustalenia niezgodnego z zasadami logiki, wiedzy i doświadczenia życiowego, poprzez wskazanie, że skoro Starosta K. dopiero decyzją z dnia 6 października 2023 r. (nr 462/2023) zatwierdził projekt rozbiórki i udzielił pozwolenia na rozbiórkę budynku kotłowni, budynku magazynowego oraz budynku rozdzielni elektrycznej, to do tego momentu należy przyjąć, że ww. budynki były wykorzystywane do działalności gospodarczej Podatnika,
- co w konsekwencji spowodowało niezgodne ze stanem rzeczywistym przyjęcie, że wszystkie nieruchomości będące w posiadaniu Podatnika w analizowanym okresie (2019 rok) były co najmniej w sposób przejściowy wykorzystywane do prowadzenia działalności gospodarczej, podczas gdy zgromadzenie w sprawie pełnego materiału dowodowego spowodowałoby prawidłowe ustalenie, że Podatnik wykorzystywał (i potencjalnie mógł wykorzystywać) w działalności gospodarczej jedynie część nieruchomości, to jest te, które zostały wskazane przez niego we wniosku o stwierdzenie nadpłaty jako wykorzystywane do prowadzenia działalności gospodarczej,
4) art. 210 § 1 pkt 6 w związku z art. 122 i art. 124 O.p., poprzez brak zawarcia w uzasadnieniu zaskarżonej decyzji wnikliwej i merytorycznej analizy materiału dowodowego sprawy oraz nienależyte wyjaśnienie w uzasadnieniu podstaw prawnych i faktycznych rozstrzygnięcia, w szczególności zaś:
a) brak w uzasadnieniu zaskarżonej decyzji należytego odniesienia się do tego, jakie okoliczności organ podatkowy ustalił na podstawie przeprowadzonych oględzin, w tym – między innymi – jaki był stan techniczny budynków oraz które z nich służą (lub mogą potencjalnie służyć) do prowadzenia działalności gospodarczej przez Podatnika,
b) lakoniczne i niewyczerpujące odniesienie się przez SKO do zarzutów przedstawionych w odwołaniu, a tym samym nierozpatrzenie całości sprawy w kontekście zgromadzonych dowodów, z uwagi na przyjęcie, że organy obu instancji zgromadziły materiał dowodowy w sposób kompleksowy i dokonały jego prawidłowej oceny,
5) art. 233 § 2 O.p. poprzez niezbadanie okoliczności faktycznych, które organy podatkowe powinny były zbadać zgodnie z wytycznymi SKO, zawartymi w decyzji uchylającej z dnia 22 kwietnia 2024 r. (nr SKO.P/41/3/24), to jest w szczególności brak przeprowadzenia w sposób należyty oględzin nieruchomości, a w konsekwencji brak ustalenia, które z obiektów objętych oględzinami nie służą do prowadzenia działalności gospodarczej,
6) art. 1a ust. 1 pkt 3 u.p.o.l., poprzez dokonanie błędnej wykładni tego przepisu i uznanie, że budynki związane z prowadzeniem działalności gospodarczej, to budynki będące w posiadaniu przedsiębiorcy, nie zaś budynki, które faktycznie służą (mogą służyć) prowadzeniu działalności gospodarczej podatnika,
7) art. 1a ust. 1 pkt 3 u.p.o.l., poprzez dokonanie błędnej wykładni ww. przepisu i nieprawidłowe uznanie, że nieruchomość stanowiąca zorganizowaną część przedsiębiorstwa w rozumieniu art. 551 k.c. jest zawsze nieruchomością związaną z prowadzeniem działalności gospodarczej w rozumieniu ww. przepisu, niezależnie od rzeczywistego sposobu jej wykorzystywania, podczas gdy spełnienie ww. przesłanki jest zależne od rzeczywistego wykorzystywania (ewentualnie potencjalnej możliwości wykorzystywania) nieruchomości w działalności gospodarczej podatnika,
8) art. 1a ust. 1 pkt 3 u.p.o.l., poprzez dokonanie błędnej wykładni tego przepisu i nieprawidłowe uznanie, że nieruchomość wprowadzona do ewidencji środków trwałych podatnika jest zawsze nieruchomością związaną z prowadzeniem działalności gospodarczej w rozumieniu ww. przepisu, niezależnie od rzeczywistego sposobu jej wykorzystywania, podczas gdy spełnienie ww. przesłanki jest zależne od rzeczywistego wykorzystywania (ewentualnie potencjalnej możliwości wykorzystywania) nieruchomości w działalności gospodarczej podatnika,
9) art. 32 Konstytucji Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 2 kwietnia 1997 r. (Dz.U. Nr 78, poz. 483 ze zm.; dalej Konstytucja), poprzez nierówne traktowanie Spółki wobec prawa oraz nierówne traktowanie przez władze publiczne.
Wskazując na powyższe naruszenia prawa, Skarżąca wniosła o uchylenie zaskarżonej decyzji oraz poprzedzającej ją decyzji Wójta w przedmiocie odmowy stwierdzenia nadpłaty z tytułu podatku od nieruchomości za 2019 rok.
2.2. Odpowiadając na skargę, SKO wniosło o jej oddalenie, podtrzymując swoje dotychczasowe stanowisko.
3. Wojewódzki Sąd Administracyjny we Wrocławiu zważył, co następuje.
3.1. Zgodnie z art. 145 § 1 ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (Dz.U. z 2026 r., poz. 143 ze zm.; dalej: p.p.s.a.), sąd uwzględniając skargę na decyzję lub postanowienie: 1) uchyla decyzję lub postanowienie w całości albo w części, jeżeli stwierdzi: a) naruszenie prawa materialnego, które miało wpływ na wynik sprawy, b) naruszenie prawa dające podstawę do wznowienia postępowania administracyjnego, c) inne naruszenie przepisów postępowania, jeżeli mogło ono mieć istotny wpływ na wynik sprawy; 2) stwierdza nieważność decyzji lub postanowienia w całości lub w części, jeżeli zachodzą przyczyny określone w art. 156 Kodeksu postępowania administracyjnego lub w innych przepisach; 3) stwierdza wydanie decyzji lub postanowienia z naruszeniem prawa, jeżeli zachodzą przyczyny określone w Kodeksie postępowania administracyjnego lub w innych przepisach. Przy tym w myśl art. 134 § 1 p.p.s.a. sąd rozstrzyga w granicach danej sprawy, nie będąc jednak związany zarzutami i wnioskami skargi oraz powołaną podstawą prawną, z zastrzeżeniem art. 57a p.p.s.a., które nie ma zastosowania w niniejszej sprawie. Zgodnie natomiast z art. 151 p.p.s.a., w razie nieuwzględnienia skargi w całości albo w części sąd oddala ją odpowiednio w całości albo w części.
3.2. Dokonując kontroli legalności zaskarżonej decyzji w świetle przywołanych przepisów p.p.s.a., Sąd stwierdził, że skarga nie miała uzasadnionych podstaw.
Warto przypomnieć, na co Kolegium zwróciło uwagę w uzasadnieniu zaskarżonej decyzji, że w tutejszym Sądzie były już rozpoznawane podobne skargi Strony, które odnosiły się do decyzji organów podatkowych obu instancji dotyczących odmowy stwierdzenia nadpłaty w podatku od nieruchomości w zakresie tych samych przedmiotów opodatkowania, tyle że za późniejsze lata podatkowe (por. wyroki z dnia z dnia 29 listopada 2022 r. o sygn. akt I SA/Wr 375/22 za rok 2020 oraz I SA/Wr 376/22 za rok 2021). W wyrokach wydanych w tamtych sprawach wskazano, że (cyt.) "z akt sprawy nie wynika, które konkretnie nieruchomości zdaniem Podatnika nie podlegają podatkowi od nieruchomości w najwyższej stawce. Organ powinien to ustalić i dopiero w kontekście tych ustaleń, i powołanego wyroku Trybunału Konstytucyjnego SK 39/19 ocenić zasadność wniosku podatnika. Organ też powinien rozważyć zasadność wniosku dowodowego o przeprowadzenie oględzin, wydając stosowne postanowienie dowodowe. W ocenie Sądu samo odniesienie się w treści uzasadnienia decyzji w tym zakresie nie jest wystarczające. W aktach też brak jest niektórych dokumentów na które powołuje się organ w uzasadnieniu decyzji. Tym samym część zarzutów skargi naruszenia przepisów postępowania należy uznać za uzasadnione.".
3.3. W rozpoznawanej sprawie przedmiotem sporu jest prawidłowość zastosowania stawek podatku od nieruchomości właściwych dla gruntów i budynków związanych z działalnością gospodarczą do opodatkowania w całości budynków posadowionych na nieruchomościach stanowiących działki o numerach ewidencyjnych [...], [...], [...], [...], [...], [...] oraz [...]. Zdaniem Strony, z uwagi na ich stan techniczny oraz niewykorzystywanie ich do prowadzenia działalności, nie powinno się do nich stosować najwyższej stawki, bowiem nie była w nich faktycznie prowadzona działalność gospodarcza. Tymczasem organy obu instancji utrzymują, że nieruchomości te pozostają związane z działalnością gospodarczą Spółki, przy czym związek ten nie ogranicza się wyłącznie do ich posiadania przez Skarżącą, albowiem spełnione są także inne kryteria wskazywane w orzecznictwie sądów administracyjnych, które istnienie tego związku dostatecznie potwierdzają.
Zatem kluczowe znaczenie w rozpatrywanej sprawie ma ustalenie, czy sporne nieruchomości (budynki) są związane z prowadzeniem działalności gospodarczej. Warto zaznaczyć na wstępie, że zagadnienie to było już przedmiotem wypowiedzi Naczelnego Sądu Administracyjnego, zawartych między innymi w wyrokach z dnia: 28 czerwca 2023 r. o sygn. akt III FSK 76/23; 8 kwietnia 2025 r. o sygn. akt III FSK 861/23; 8 maja 2025 r. o sygn. akt III FSK 1409/23; 21 sierpnia 2025 r. o sygn. akt III FSK 581/24; 15 października 2025 r. o sygn. akt III FSK 961/24 czy też 26 listopada 2025 r. o sygn. akt III FSK 248/25 i III FSK 259/25. Sąd w składzie rozpoznającym niniejszą sprawę podziela stanowisko wyrażone w tych orzeczeniach, tym bardziej, że dwa ostatnie spośród powołanych wyżej wyroków oddalały skargi kasacyjne podatników, których skargi w sprawach o zasadniczo zbieżnej osi sporu zostały przez tutejszy Sąd oddalone. Brak zatem podstaw, aby podzielić argumentację przeciwną Skarżącej, która stanowi jedynie nieprzekonującą polemikę Strony z poglądem, który jest już mocno ugruntowany w orzecznictwie nie tylko NSA, lecz także innych sądów administracyjnych, w tym również tutejszego Sądu.
3.4. W ustosunkowaniu się do zarzutów, zawartych w złożonej skardze, pokreślić należy, że wbrew zawartym w niej twierdzeniom, w uzasadnieniu skarżonej decyzji organ odwoławczy przywołał argumentację faktyczną oraz prawną, przemawiającą za utrzymaniem w mocy wydanego w pierwszej instancji orzeczenia podatkowego.
Należy zatem wskazać, że zgodnie z art. 1a ust. 1 pkt 3 u.p.o.l. grunty, budynki i budowle związane z prowadzeniem działalności gospodarczej – to grunty, budynki i budowle będące w posiadaniu przedsiębiorcy lub innego podmiotu prowadzącego działalność gospodarczą, z zastrzeżeniem ust. 2a. Zawarta w tym przepisie definicja gruntu, budynku i budowli, "związanych z prowadzeniem działalności gospodarczej", musi być oczywiście odczytywana w zgodzie z tezą wyroku Trybunału Konstytucyjnego z dnia 23 lutego 2021 r., SK 39/19, w którym stwierdzono, że przywołany przepis, rozumiany w ten sposób, że o związaniu gruntu, budynku lub budowli z prowadzeniem działalności gospodarczej decyduje wyłącznie posiadanie gruntu, budynku lub budowli przez przedsiębiorcę lub inny podmiot prowadzący działalność gospodarczą, jest niezgodny z art. 64 ust. 1 w związku z art. 31 ust. 3 i art. 84 Konstytucji Rzeczypospolitej Polskiej. Po wydaniu przywołanego wyroku TK jasne stało się, że sam fakt posiadania nieruchomości przez przedsiębiorcę, bez względu na jego status i formę organizacyjnoprawną (osoba fizyczna, prawna), nie jest wystarczający do uznania związku tej nieruchomości z prowadzoną działalnością gospodarczą.
Pojawił się natomiast problem doprecyzowania "związku" nieruchomości z prowadzeniem działalności gospodarczej. W orzecznictwie Naczelnego Sądu Administracyjnego ukształtowany został pogląd, że związek ten, oprócz samego posiadania nieruchomości przez przedsiębiorcę lub inny podmiot prowadzący działalność gospodarczą, powinien być oparty na faktycznym lub nawet potencjalnym wykorzystywaniu tej nieruchomości w działalności gospodarczej tego podmiotu. Grunty, budynki i budowle, które choćby pośrednio lub w ograniczonym zakresie służą prowadzeniu działalności gospodarczej, powinny być uznane za związane z tą działalnością. Zdaniem NSA w ustaleniu istnienia związku nieruchomości z prowadzoną działalnością gospodarczą przydatne mogą być na przykład takie okoliczności jak: wprowadzenie nieruchomości do ewidencji środków trwałych, ujęcie wydatków na nabycie lub wytworzenie oraz utrzymanie w kosztach działalności gospodarczej. O istnieniu takiego związku może też świadczyć charakter rzeczy (np. budowli), wskazujący na jej gospodarcze przeznaczenie (por. wyroki NSA z dnia 4 marca 2021 r. o sygn. akt III FSK 895-898/21). Za związane z działalnością gospodarczą w rozumieniu art. 1a ust. 1 pkt 3 u.p.o.l. można uznać nieruchomości stanowiące własność podatnika (znajdujące się w posiadaniu samoistnym albo użytkowaniu wieczystym), które są w posiadaniu przedsiębiorcy (innego podmiotu prowadzącego działalność gospodarczą) oraz jednocześnie: (1) wchodzą w skład prowadzonego przez niego przedsiębiorstwa w rozumieniu art. 55¹ kodeksu cywilnego, w szczególności gdy podatnik ujął te składniki majątkowe w prowadzonej ewidencji środków trwałych wartości niematerialnych i prawnych, bez względu na to, czy nieruchomość jest wykorzystywana na prowadzenie działalności gospodarczej lub (2) przedmiot działalności przedsiębiorcy obejmuje jedynie prowadzenie działalności gospodarczej, bez względu na to, czy nieruchomość jest wykorzystywana na prowadzenie działalności gospodarczej, lub (3) nieruchomości są funkcjonalnie powiązane z przedsiębiorstwem prowadzonym przez podmiot, w którego posiadaniu się znajdują, nawet jeżeli nie zostały uwzględnione w ewidencji środków trwałych wartości niematerialnych i prawnych, tzn.: są faktycznie wykorzystywane do prowadzenia działalności gospodarczej w znaczeniu zdefiniowanym w art. 1a ust. 1 pkt 4 u.p.o.l. albo mogą być potencjalnie wykorzystywane do prowadzenia działalności gospodarczej w ww. rozumieniu, przez co należy rozumieć sytuację, w której przedsiębiorca podejmuje i realizuje zachowania kwalifikowane w obrębie przedmiotu opodatkowania jako czynności mające na celu przygotowanie, zachowanie lub zabezpieczenie nieruchomości do przyszłej (planowanej) działalności gospodarczej, bądź do kontynuacji przerwanej działalności gospodarczej, związane z ponoszeniem wydatków rozliczanych w kosztach uzyskania przychodów prowadzonej działalności gospodarczej (por. wyrok NSA z dnia 15 grudnia 2021 r. o sygn. akt III FSK 4061/21).
3.5. W sprawie niniejszej organy obu instancji, dokonując wykładni art. 1a ust. 1 pkt 3 u.p.o.l., uwzględniły wnioski wynikające z wyroku TK z dnia 24 lutego 2021 r. o sygn. akt SK 39/19. Zarówno Wójt, jak i Kolegium, wykazały dowodnie, że sporne nieruchomości mają związek z prowadzoną działalnością gospodarczą, a związek ten nie jest oparty na samym posiadaniu tych nieruchomości przez Spółkę. Trafnie jako podstawę do twierdzenia o istnieniu związku z działalnością gospodarczą w zakresie obrotu nieruchomościami organy te przyjęły: status Strony jako przedsiębiorcy oraz jej formę organizacyjnoprawną (spółka z o.o. zarejestrowana w Rejestrze Przedsiębiorców KRS), przedmiot prowadzonej przez nią działalności gospodarczej i brak jakiejkolwiek innej aktywności poza tego typu działalnością, podejmowanie wobec spornych budynków czynności przygotowawczych do ich wynajęcia lub wydzierżawienia na komercyjne przedsięwzięcia innych podmiotów gospodarczych, nabycie spornych nieruchomości jako składników zorganizowanej części przedsiębiorstwa zdolnych do realizacji ich funkcji gospodarczych (por. w szczególności str. 17 notarialnej umowy sprzedaży z dnia 27 maja 2019 r. – poz. 39 w segregatorze nr 2 akt administracyjnych), wprowadzenie ich do ewidencji środków trwałych oraz rozliczanie kosztów ich nabycia w ramach amortyzacji. Organy przeanalizowały obowiązujące w tym zakresie regulacje prawne oraz wiodące orzecznictwo Naczelnego Sądu Administracyjnego, wskazujące na związek spornych nieruchomości z działalnością gospodarczą Podatnika. Sąd ustalenia te oraz wywiedzione z nich wnioski i oceny w pełni aprobuje.
3.6. W konsekwencji za niezasadne należy uznać zarzuty naruszenia wymienionych w skardze kasacyjnej przepisów prawa materialnego i procesowego.
Niezasadne w szczególności są zarzuty dotyczące prawidłowości ustaleń stanu faktycznego. Wbrew stanowisku Skarżącej, organy podjęły niezbędne działania w celu dokładnego wyjaśnienia stanu faktycznego (art. 122 O.p.), zebrały i w sposób wyczerpujący rozpatrzyły cały materiał dowodowy (art. 187 § 1 O.p.) i na podstawie tego materiału dokonały prawidłowych ustaleń faktycznych, nie przekraczając przy tym granic swobodnej oceny dowodów (art. 191 O.p.).
W prawidłowo ustalonym stanie faktycznym sprawy, organy obu instancji dokonały właściwej wykładni i prawidłowo zastosowały odnośne przepisy prawa materialnego, w tym wymieniony w skardze art. 1a ust. 1 pkt 3 i 4 u.p.o.l., odmawiając w konsekwencji tegoż stwierdzenia wnioskowanej nadpłaty po myśl art. 75 § 4a O.p. Zgodnie z tym przepisem, w decyzji stwierdzającej nadpłatę organ podatkowy określa wysokość zobowiązania podatkowego w prawidłowej wysokości w takim zakresie, w jakim powstanie nadpłaty jest związane ze zmianą wysokości zobowiązania podatkowego (zdanie pierwsze § 4a powołanego artykułu). W zakresie, w jakim wniosek jest niezasadny organ odmawia stwierdzenia nadpłaty (zdanie drugie § 4a powołanego artykułu). Wójt i Kolegium wypełniły zalecenia zawarte w powołanych wcześniej wyrokach kasatoryjnych tutejszego Sądu. Co się zaś tyczy odmowy uwzględnienia wniosków dowodowych Strony, to nie tylko były one zbędne, zważywszy na zgromadzony w sprawie materiał dowodowy, w tym akt notarialny umowy sprzedaży zorganizowanej części przedsiębiorstwa z dnia 27 maja 2019 r. i zapisy ewidencji środków trwałych Spółki, zaoferowany zresztą przez samą Skarżącą, lecz w zakresie dowodów osobowych mogłyby zmierzać do wykazania okoliczności przeciwko treści ww. dokumentu urzędowego oraz ksiąg rachunkowych Podatnika, co zresztą trudno uznać za zgodne z jego intencjami.
3.7. Warto również zwrócić uwagę na ekonomiczny aspekt zarzutów sformułowanych w skardze. Skarżąca nie dostrzega albo nie chce dostrzec faktu, że podatek od nieruchomości stanowi ważne źródło wpływów budżetowych gmin, a jako podatek majątkowy obciąża on koszty działalności każdego przedsiębiorcy posiadającego nieruchomości wykorzystywane w ramach jego działalności gospodarczej bez względu na to, czy i w jakim zakresie on je odpowiednio zagospodarować oraz jaki skutek ekonomiczny (zysk albo strata) wynika z tej okoliczności. Konieczność płacenia tego podatku jest elementem ryzyka gospodarczego, który obciąża wyłącznie przedsiębiorcę. Tymczasem w okolicznościach sprawy Spółka zmierza do przerzucenia owego ryzyka częściowo na gminę, pomijając choćby okoliczność, że od chwili zakupu całej zorganizowanej części przedsiębiorstwa stanowiącej fabrykę [...] w maju 2019 r. do jej wyceny przez rzeczoznawcę majątkowego w 2024 r. wartość nieruchomości, uwzględniając nawet realia sprzedaży wymuszonej (czyli w ramach egzekucji lub upadłości), wzrosła przynajmniej dwukrotnie, przekraczając sumę 10 milionów zł (por. operat szacunkowy w pliku pism pod poz. 28 w segregatorze nr 1 akt administracyjnych). Jeśli zatem przedsiębiorca nie jest w stanie wykorzystać gospodarczo niektórych spośród swoich gruntów i budynków, także z uwagi na ich stan techniczny, a niezbędne do poniesienia nakłady lub koszty ich utrzymania, w tym podatek od nieruchomości, stanowią dla niego zbyt duże obciążenie, to powinien zbędną ich część sprzedać. Bezpodstawne jest natomiast z jego strony oczekiwanie, że ich zły stan techniczny uzasadnia przyjęcie, że nieruchomości te w ogóle nie mogą być z tego względu wykorzystane w ramach prowadzonej przez niego działalności gospodarczej. Ostatecznie bowiem sprzedaż zbędnych składników majątku przedsiębiorstwa także stanowi przejaw prowadzonej przez przedsiębiorcę działalności gospodarczej.
Z kolei co się tyczy stanu budynków, to nie miał on znaczenia dla opodatkowania z uwagi na to, że z dniem 1 stycznia 2016 r. – na skutek wejścia w życie ustawy z dnia 25 czerwca 2015 r. o zmianie ustawy o samorządzie gminnym oraz niektórych innych ustaw (Dz.U. z 2015 r., poz. 1045) – zmieniony został przepis art. 1a ust. 1 pkt 3 i dodany został przepis art. 1a ust. 2a u.p.o.l. Na skutek tych zmian z przepisów od 2016 r. wyeliminowano w art. 1a ust. 1 pkt 3 u.p.o.l. warunek wystąpienia "względów technicznych" jako mający prawnopodatkowe znaczenie. Zgodnie z art. 1a ust. 1 pkt 3 u.p.o.l. (w stanie prawnym obowiązującym dla niniejszej sprawy) grunty budynki i budowle związane z prowadzeniem działalności gospodarczej - to grunty, budynki i budowle będące w posiadaniu przedsiębiorcy lub innego podmiotu prowadzącego działalność gospodarczą, z zastrzeżeniem ust. 2a. Przepis art. 1a ust. 2a u.p.o.l. stanowi zaś, że do gruntów, budynków i budowli związanych z prowadzeniem działalności gospodarczej nie zalicza się budynków, budowli lub ich części, w odniesieniu do których została wydana decyzja ostateczna organu nadzoru budowlanego, o której mowa w art. 67 ust. 1 ustawy z dnia 7 lipca 1994 r. - Prawo budowlane (Dz.U. z 2016 r. poz. 290), lub decyzja ostateczna organu nadzoru górniczego, na podstawie której trwale wyłączono budynek, budowlę lub ich części z użytkowania. W okolicznościach niniejszej sprawy przesłanka ta nie ziściła się, bowiem wydanie decyzji o pozwoleniu na rozbiórkę niektórych budynków nastąpiło dopiero w 2023 r. (por. poz. 29 w segregatorze nr 1 akt administracyjnych).
3.8. Mając powyższe na uwadze, Sąd nie dopatrzył się zarzucanych w skardze naruszeń przepisów prawa materialnego, ani procesowego, w tym w szczególności zasad ogólnych prowadzenia postępowania, określonych w art. 187 § 1, art. 121, art. 122 i art. 124 O.p., jak i przywołanych przepisów Konstytucji RP.
3.9. W konsekwencji powyższego, uznając zarzuty skargi za nieuzasadnione, a równocześnie nie stwierdzając innych naruszeń prawa, które zobowiązywałyby Sąd w oparciu o art. 145 p.p.s.a. do wyeliminowania z obrotu prawnego zaskarżonej decyzji, na podstawie art. 151 p.p.s.a., skargę oddalono.